Protein–RNA interactions for Protein: P36578

RPL4, 60S ribosomal protein L4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL4P36578 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPL4P36578 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RPL4P36578 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPL4P36578 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RPL4P36578 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPL4P36578 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPL4P36578 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
RPL4P36578 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPL4P36578 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPL4P36578 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPL4P36578 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPL4P36578 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RPL4P36578 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RPL4P36578 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RPL4P36578 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPL4P36578 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RPL4P36578 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RPL4P36578 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPL4P36578 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPL4P36578 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPL4P36578 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPL4P36578 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RPL4P36578 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RPL4P36578 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RPL4P36578 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPL4P36578 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPL4P36578 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPL4P36578 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPL4P36578 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RPL4P36578 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RPL4P36578 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RPL4P36578 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RPL4P36578 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RPL4P36578 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPL4P36578 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPL4P36578 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RPL4P36578 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RPL4P36578 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RPL4P36578 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPL4P36578 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPL4P36578 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPL4P36578 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPL4P36578 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPL4P36578 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RPL4P36578 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPL4P36578 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPL4P36578 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RPL4P36578 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RPL4P36578 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RPL4P36578 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPL4P36578 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPL4P36578 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPL4P36578 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
RPL4P36578 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RPL4P36578 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPL4P36578 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPL4P36578 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPL4P36578 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPL4P36578 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPL4P36578 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPL4P36578 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPL4P36578 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPL4P36578 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPL4P36578 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPL4P36578 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPL4P36578 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPL4P36578 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPL4P36578 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPL4P36578 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPL4P36578 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPL4P36578 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPL4P36578 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPL4P36578 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPL4P36578 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPL4P36578 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPL4P36578 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPL4P36578 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPL4P36578 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPL4P36578 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPL4P36578 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPL4P36578 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPL4P36578 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPL4P36578 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPL4P36578 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPL4P36578 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPL4P36578 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPL4P36578 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPL4P36578 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RPL4P36578 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPL4P36578 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPL4P36578 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPL4P36578 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPL4P36578 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPL4P36578 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPL4P36578 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPL4P36578 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPL4P36578 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPL4P36578 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RPL4P36578 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPL4P36578 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms