Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GJB2P29033 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GJB2P29033 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GJB2P29033 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GJB2P29033 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GJB2P29033 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
GJB2P29033 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GJB2P29033 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GJB2P29033 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GJB2P29033 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GJB2P29033 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GJB2P29033 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
GJB2P29033 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GJB2P29033 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GJB2P29033 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GJB2P29033 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
GJB2P29033 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GJB2P29033 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GJB2P29033 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
GJB2P29033 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
GJB2P29033 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
GJB2P29033 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.56■■■□□ 2
GJB2P29033 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GJB2P29033 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GJB2P29033 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GJB2P29033 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.55■■■□□ 2
GJB2P29033 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GJB2P29033 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.55■■■□□ 2
GJB2P29033 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GJB2P29033 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GJB2P29033 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GJB2P29033 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GJB2P29033 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GJB2P29033 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
GJB2P29033 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
GJB2P29033 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
GJB2P29033 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
GJB2P29033 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
GJB2P29033 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GJB2P29033 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
GJB2P29033 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GJB2P29033 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GJB2P29033 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
GJB2P29033 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GJB2P29033 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GJB2P29033 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GJB2P29033 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GJB2P29033 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
GJB2P29033 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
GJB2P29033 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GJB2P29033 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GJB2P29033 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GJB2P29033 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GJB2P29033 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GJB2P29033 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GJB2P29033 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GJB2P29033 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GJB2P29033 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GJB2P29033 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GJB2P29033 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GJB2P29033 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GJB2P29033 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GJB2P29033 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GJB2P29033 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GJB2P29033 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GJB2P29033 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GJB2P29033 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GJB2P29033 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GJB2P29033 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GJB2P29033 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GJB2P29033 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GJB2P29033 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GJB2P29033 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GJB2P29033 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GJB2P29033 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GJB2P29033 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GJB2P29033 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GJB2P29033 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GJB2P29033 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GJB2P29033 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GJB2P29033 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GJB2P29033 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GJB2P29033 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GJB2P29033 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GJB2P29033 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GJB2P29033 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GJB2P29033 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GJB2P29033 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
GJB2P29033 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
GJB2P29033 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
GJB2P29033 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GJB2P29033 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GJB2P29033 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GJB2P29033 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GJB2P29033 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GJB2P29033 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GJB2P29033 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GJB2P29033 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GJB2P29033 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GJB2P29033 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms