Protein–RNA interactions for Protein: P26998

CRYBB3, Beta-crystallin B3, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRYBB3P26998 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CRYBB3P26998 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CRYBB3P26998 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CRYBB3P26998 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CRYBB3P26998 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CRYBB3P26998 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CRYBB3P26998 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CRYBB3P26998 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CRYBB3P26998 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CRYBB3P26998 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CRYBB3P26998 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CRYBB3P26998 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CRYBB3P26998 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CRYBB3P26998 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CRYBB3P26998 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CRYBB3P26998 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CRYBB3P26998 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CRYBB3P26998 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CRYBB3P26998 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
CRYBB3P26998 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRYBB3P26998 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRYBB3P26998 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRYBB3P26998 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRYBB3P26998 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRYBB3P26998 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRYBB3P26998 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRYBB3P26998 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CRYBB3P26998 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRYBB3P26998 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRYBB3P26998 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRYBB3P26998 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRYBB3P26998 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRYBB3P26998 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRYBB3P26998 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRYBB3P26998 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRYBB3P26998 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRYBB3P26998 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRYBB3P26998 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRYBB3P26998 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRYBB3P26998 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRYBB3P26998 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRYBB3P26998 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRYBB3P26998 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRYBB3P26998 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRYBB3P26998 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRYBB3P26998 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRYBB3P26998 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRYBB3P26998 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRYBB3P26998 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRYBB3P26998 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRYBB3P26998 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRYBB3P26998 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRYBB3P26998 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRYBB3P26998 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRYBB3P26998 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRYBB3P26998 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRYBB3P26998 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRYBB3P26998 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRYBB3P26998 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRYBB3P26998 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRYBB3P26998 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRYBB3P26998 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRYBB3P26998 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRYBB3P26998 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRYBB3P26998 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CRYBB3P26998 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CRYBB3P26998 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CRYBB3P26998 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CRYBB3P26998 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CRYBB3P26998 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CRYBB3P26998 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CRYBB3P26998 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CRYBB3P26998 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CRYBB3P26998 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CRYBB3P26998 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CRYBB3P26998 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CRYBB3P26998 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CRYBB3P26998 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CRYBB3P26998 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CRYBB3P26998 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CRYBB3P26998 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CRYBB3P26998 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CRYBB3P26998 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CRYBB3P26998 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CRYBB3P26998 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CRYBB3P26998 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CRYBB3P26998 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CRYBB3P26998 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CRYBB3P26998 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CRYBB3P26998 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CRYBB3P26998 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CRYBB3P26998 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CRYBB3P26998 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CRYBB3P26998 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CRYBB3P26998 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CRYBB3P26998 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CRYBB3P26998 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CRYBB3P26998 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CRYBB3P26998 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CRYBB3P26998 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms