Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NFKBIAP25963 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NFKBIAP25963 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NFKBIAP25963 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NFKBIAP25963 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NFKBIAP25963 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NFKBIAP25963 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NFKBIAP25963 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NFKBIAP25963 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NFKBIAP25963 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NFKBIAP25963 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NFKBIAP25963 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NFKBIAP25963 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NFKBIAP25963 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NFKBIAP25963 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NFKBIAP25963 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NFKBIAP25963 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
NFKBIAP25963 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
NFKBIAP25963 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NFKBIAP25963 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NFKBIAP25963 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NFKBIAP25963 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NFKBIAP25963 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NFKBIAP25963 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NFKBIAP25963 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NFKBIAP25963 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NFKBIAP25963 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NFKBIAP25963 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NFKBIAP25963 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NFKBIAP25963 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NFKBIAP25963 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NFKBIAP25963 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NFKBIAP25963 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NFKBIAP25963 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NFKBIAP25963 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NFKBIAP25963 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NFKBIAP25963 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NFKBIAP25963 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NFKBIAP25963 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NFKBIAP25963 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NFKBIAP25963 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NFKBIAP25963 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NFKBIAP25963 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NFKBIAP25963 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NFKBIAP25963 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NFKBIAP25963 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NFKBIAP25963 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NFKBIAP25963 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NFKBIAP25963 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NFKBIAP25963 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NFKBIAP25963 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NFKBIAP25963 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NFKBIAP25963 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NFKBIAP25963 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NFKBIAP25963 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NFKBIAP25963 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NFKBIAP25963 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NFKBIAP25963 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NFKBIAP25963 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NFKBIAP25963 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NFKBIAP25963 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NFKBIAP25963 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NFKBIAP25963 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NFKBIAP25963 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NFKBIAP25963 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NFKBIAP25963 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NFKBIAP25963 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NFKBIAP25963 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NFKBIAP25963 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NFKBIAP25963 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NFKBIAP25963 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NFKBIAP25963 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NFKBIAP25963 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NFKBIAP25963 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NFKBIAP25963 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NFKBIAP25963 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NFKBIAP25963 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NFKBIAP25963 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NFKBIAP25963 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NFKBIAP25963 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NFKBIAP25963 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NFKBIAP25963 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NFKBIAP25963 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NFKBIAP25963 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NFKBIAP25963 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NFKBIAP25963 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NFKBIAP25963 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NFKBIAP25963 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NFKBIAP25963 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NFKBIAP25963 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NFKBIAP25963 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NFKBIAP25963 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NFKBIAP25963 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NFKBIAP25963 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NFKBIAP25963 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NFKBIAP25963 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NFKBIAP25963 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NFKBIAP25963 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NFKBIAP25963 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NFKBIAP25963 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms