Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
POLR2AP24928 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
POLR2AP24928 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
POLR2AP24928 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
POLR2AP24928 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
POLR2AP24928 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
POLR2AP24928 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
POLR2AP24928 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
POLR2AP24928 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
POLR2AP24928 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
POLR2AP24928 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
POLR2AP24928 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
POLR2AP24928 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
POLR2AP24928 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
POLR2AP24928 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
POLR2AP24928 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
POLR2AP24928 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
POLR2AP24928 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
POLR2AP24928 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
POLR2AP24928 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
POLR2AP24928 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
POLR2AP24928 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
POLR2AP24928 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
POLR2AP24928 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
POLR2AP24928 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
POLR2AP24928 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
POLR2AP24928 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
POLR2AP24928 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
POLR2AP24928 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
POLR2AP24928 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
POLR2AP24928 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
POLR2AP24928 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
POLR2AP24928 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
POLR2AP24928 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
POLR2AP24928 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
POLR2AP24928 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
POLR2AP24928 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
POLR2AP24928 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
POLR2AP24928 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
POLR2AP24928 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
POLR2AP24928 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
POLR2AP24928 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
POLR2AP24928 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
POLR2AP24928 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
POLR2AP24928 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
POLR2AP24928 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
POLR2AP24928 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
POLR2AP24928 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
POLR2AP24928 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
POLR2AP24928 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
POLR2AP24928 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
POLR2AP24928 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
POLR2AP24928 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
POLR2AP24928 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
POLR2AP24928 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
POLR2AP24928 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
POLR2AP24928 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
POLR2AP24928 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
POLR2AP24928 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
POLR2AP24928 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
POLR2AP24928 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
POLR2AP24928 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
POLR2AP24928 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
POLR2AP24928 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
POLR2AP24928 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
POLR2AP24928 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
POLR2AP24928 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
POLR2AP24928 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
POLR2AP24928 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
POLR2AP24928 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
POLR2AP24928 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
POLR2AP24928 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
POLR2AP24928 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
POLR2AP24928 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
POLR2AP24928 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
POLR2AP24928 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
POLR2AP24928 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
POLR2AP24928 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
POLR2AP24928 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
POLR2AP24928 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
POLR2AP24928 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
POLR2AP24928 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
POLR2AP24928 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
POLR2AP24928 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
POLR2AP24928 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
POLR2AP24928 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
POLR2AP24928 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
POLR2AP24928 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
POLR2AP24928 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
POLR2AP24928 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
POLR2AP24928 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
POLR2AP24928 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
POLR2AP24928 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
POLR2AP24928 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
POLR2AP24928 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
POLR2AP24928 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
POLR2AP24928 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
POLR2AP24928 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
POLR2AP24928 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
POLR2AP24928 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms