Protein–RNA interactions for Protein: P24390

KDELR1, ER lumen protein-retaining receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR1P24390 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDELR1P24390 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDELR1P24390 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDELR1P24390 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDELR1P24390 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDELR1P24390 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDELR1P24390 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDELR1P24390 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDELR1P24390 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDELR1P24390 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDELR1P24390 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDELR1P24390 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDELR1P24390 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDELR1P24390 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDELR1P24390 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDELR1P24390 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDELR1P24390 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDELR1P24390 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDELR1P24390 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDELR1P24390 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDELR1P24390 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
KDELR1P24390 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDELR1P24390 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDELR1P24390 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDELR1P24390 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDELR1P24390 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDELR1P24390 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDELR1P24390 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
KDELR1P24390 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDELR1P24390 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDELR1P24390 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDELR1P24390 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDELR1P24390 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDELR1P24390 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDELR1P24390 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDELR1P24390 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDELR1P24390 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDELR1P24390 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDELR1P24390 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
KDELR1P24390 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
KDELR1P24390 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KDELR1P24390 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
KDELR1P24390 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KDELR1P24390 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KDELR1P24390 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KDELR1P24390 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KDELR1P24390 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KDELR1P24390 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KDELR1P24390 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KDELR1P24390 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KDELR1P24390 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KDELR1P24390 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KDELR1P24390 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
KDELR1P24390 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KDELR1P24390 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KDELR1P24390 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDELR1P24390 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDELR1P24390 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDELR1P24390 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDELR1P24390 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
KDELR1P24390 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDELR1P24390 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDELR1P24390 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDELR1P24390 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDELR1P24390 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KDELR1P24390 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KDELR1P24390 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KDELR1P24390 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KDELR1P24390 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
KDELR1P24390 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KDELR1P24390 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KDELR1P24390 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KDELR1P24390 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
KDELR1P24390 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KDELR1P24390 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KDELR1P24390 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KDELR1P24390 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KDELR1P24390 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KDELR1P24390 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KDELR1P24390 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KDELR1P24390 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KDELR1P24390 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KDELR1P24390 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KDELR1P24390 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
KDELR1P24390 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KDELR1P24390 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KDELR1P24390 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KDELR1P24390 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDELR1P24390 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDELR1P24390 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDELR1P24390 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDELR1P24390 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDELR1P24390 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDELR1P24390 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDELR1P24390 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDELR1P24390 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDELR1P24390 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDELR1P24390 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDELR1P24390 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDELR1P24390 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms