Protein–RNA interactions for Protein: P22694

PRKACB, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKACBP22694 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRKACBP22694 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRKACBP22694 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRKACBP22694 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRKACBP22694 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRKACBP22694 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRKACBP22694 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRKACBP22694 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRKACBP22694 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRKACBP22694 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRKACBP22694 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRKACBP22694 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRKACBP22694 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRKACBP22694 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRKACBP22694 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRKACBP22694 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRKACBP22694 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PRKACBP22694 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PRKACBP22694 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PRKACBP22694 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PRKACBP22694 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PRKACBP22694 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PRKACBP22694 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PRKACBP22694 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PRKACBP22694 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PRKACBP22694 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PRKACBP22694 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PRKACBP22694 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PRKACBP22694 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PRKACBP22694 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PRKACBP22694 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PRKACBP22694 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PRKACBP22694 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PRKACBP22694 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PRKACBP22694 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PRKACBP22694 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PRKACBP22694 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PRKACBP22694 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PRKACBP22694 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PRKACBP22694 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PRKACBP22694 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRKACBP22694 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRKACBP22694 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRKACBP22694 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRKACBP22694 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PRKACBP22694 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PRKACBP22694 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRKACBP22694 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRKACBP22694 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRKACBP22694 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRKACBP22694 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRKACBP22694 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRKACBP22694 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRKACBP22694 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRKACBP22694 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRKACBP22694 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRKACBP22694 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRKACBP22694 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRKACBP22694 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRKACBP22694 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRKACBP22694 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRKACBP22694 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRKACBP22694 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRKACBP22694 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRKACBP22694 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRKACBP22694 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PRKACBP22694 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRKACBP22694 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRKACBP22694 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRKACBP22694 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRKACBP22694 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRKACBP22694 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRKACBP22694 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PRKACBP22694 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRKACBP22694 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRKACBP22694 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRKACBP22694 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRKACBP22694 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRKACBP22694 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRKACBP22694 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PRKACBP22694 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRKACBP22694 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRKACBP22694 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRKACBP22694 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRKACBP22694 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRKACBP22694 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRKACBP22694 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRKACBP22694 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRKACBP22694 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRKACBP22694 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRKACBP22694 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRKACBP22694 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRKACBP22694 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRKACBP22694 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PRKACBP22694 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRKACBP22694 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRKACBP22694 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRKACBP22694 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRKACBP22694 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PRKACBP22694 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.2 ms