Protein–RNA interactions for Protein: P20849

COL9A1, Collagen alpha-1(IX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A1P20849 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
COL9A1P20849 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
COL9A1P20849 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COL9A1P20849 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
COL9A1P20849 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
COL9A1P20849 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
COL9A1P20849 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
COL9A1P20849 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
COL9A1P20849 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
COL9A1P20849 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
COL9A1P20849 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL9A1P20849 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL9A1P20849 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL9A1P20849 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL9A1P20849 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL9A1P20849 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL9A1P20849 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL9A1P20849 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL9A1P20849 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL9A1P20849 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL9A1P20849 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL9A1P20849 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL9A1P20849 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL9A1P20849 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL9A1P20849 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL9A1P20849 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
COL9A1P20849 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL9A1P20849 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
COL9A1P20849 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
COL9A1P20849 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL9A1P20849 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
COL9A1P20849 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL9A1P20849 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL9A1P20849 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL9A1P20849 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL9A1P20849 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL9A1P20849 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL9A1P20849 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL9A1P20849 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL9A1P20849 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL9A1P20849 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL9A1P20849 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL9A1P20849 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
COL9A1P20849 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL9A1P20849 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL9A1P20849 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL9A1P20849 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL9A1P20849 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COL9A1P20849 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
COL9A1P20849 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COL9A1P20849 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COL9A1P20849 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COL9A1P20849 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COL9A1P20849 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
COL9A1P20849 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COL9A1P20849 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
COL9A1P20849 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
COL9A1P20849 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COL9A1P20849 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
COL9A1P20849 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
COL9A1P20849 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COL9A1P20849 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COL9A1P20849 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COL9A1P20849 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COL9A1P20849 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COL9A1P20849 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COL9A1P20849 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COL9A1P20849 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COL9A1P20849 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COL9A1P20849 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL9A1P20849 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL9A1P20849 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COL9A1P20849 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COL9A1P20849 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COL9A1P20849 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COL9A1P20849 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
COL9A1P20849 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COL9A1P20849 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
COL9A1P20849 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COL9A1P20849 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL9A1P20849 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL9A1P20849 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL9A1P20849 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL9A1P20849 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL9A1P20849 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL9A1P20849 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
COL9A1P20849 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL9A1P20849 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COL9A1P20849 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COL9A1P20849 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COL9A1P20849 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COL9A1P20849 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COL9A1P20849 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COL9A1P20849 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COL9A1P20849 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COL9A1P20849 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COL9A1P20849 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COL9A1P20849 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COL9A1P20849 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
COL9A1P20849 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms