Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM21P19474 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM21P19474 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM21P19474 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM21P19474 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM21P19474 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM21P19474 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM21P19474 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM21P19474 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM21P19474 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM21P19474 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM21P19474 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM21P19474 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM21P19474 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM21P19474 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM21P19474 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM21P19474 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM21P19474 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM21P19474 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM21P19474 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM21P19474 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM21P19474 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM21P19474 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM21P19474 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM21P19474 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM21P19474 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM21P19474 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM21P19474 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM21P19474 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
TRIM21P19474 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TRIM21P19474 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM21P19474 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM21P19474 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM21P19474 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM21P19474 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM21P19474 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM21P19474 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM21P19474 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM21P19474 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM21P19474 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM21P19474 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM21P19474 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM21P19474 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM21P19474 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM21P19474 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM21P19474 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM21P19474 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM21P19474 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM21P19474 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM21P19474 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM21P19474 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM21P19474 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM21P19474 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM21P19474 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM21P19474 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM21P19474 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM21P19474 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM21P19474 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM21P19474 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM21P19474 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM21P19474 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM21P19474 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM21P19474 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM21P19474 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM21P19474 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM21P19474 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM21P19474 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM21P19474 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM21P19474 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM21P19474 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM21P19474 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM21P19474 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM21P19474 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM21P19474 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM21P19474 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM21P19474 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM21P19474 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM21P19474 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM21P19474 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM21P19474 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM21P19474 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM21P19474 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM21P19474 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM21P19474 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM21P19474 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM21P19474 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM21P19474 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM21P19474 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM21P19474 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM21P19474 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM21P19474 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM21P19474 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM21P19474 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM21P19474 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM21P19474 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM21P19474 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM21P19474 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM21P19474 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM21P19474 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM21P19474 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms