Protein–RNA interactions for Protein: P19447

ERCC3, TFIIH basal transcription factor complex helicase XPB subunit, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC3P19447 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
ERCC3P19447 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ERCC3P19447 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ERCC3P19447 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ERCC3P19447 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ERCC3P19447 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
ERCC3P19447 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ERCC3P19447 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ERCC3P19447 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ERCC3P19447 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
ERCC3P19447 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ERCC3P19447 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ERCC3P19447 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ERCC3P19447 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ERCC3P19447 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ERCC3P19447 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ERCC3P19447 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ERCC3P19447 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ERCC3P19447 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ERCC3P19447 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ERCC3P19447 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ERCC3P19447 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ERCC3P19447 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ERCC3P19447 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ERCC3P19447 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ERCC3P19447 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ERCC3P19447 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ERCC3P19447 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ERCC3P19447 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ERCC3P19447 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ERCC3P19447 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ERCC3P19447 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ERCC3P19447 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ERCC3P19447 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ERCC3P19447 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
ERCC3P19447 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ERCC3P19447 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ERCC3P19447 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ERCC3P19447 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ERCC3P19447 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ERCC3P19447 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ERCC3P19447 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ERCC3P19447 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ERCC3P19447 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ERCC3P19447 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ERCC3P19447 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ERCC3P19447 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ERCC3P19447 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ERCC3P19447 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ERCC3P19447 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ERCC3P19447 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ERCC3P19447 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ERCC3P19447 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ERCC3P19447 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ERCC3P19447 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
ERCC3P19447 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ERCC3P19447 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ERCC3P19447 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ERCC3P19447 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.96
ERCC3P19447 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ERCC3P19447 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ERCC3P19447 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ERCC3P19447 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ERCC3P19447 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ERCC3P19447 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ERCC3P19447 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ERCC3P19447 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ERCC3P19447 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ERCC3P19447 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ERCC3P19447 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ERCC3P19447 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ERCC3P19447 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ERCC3P19447 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ERCC3P19447 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ERCC3P19447 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ERCC3P19447 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ERCC3P19447 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ERCC3P19447 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ERCC3P19447 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ERCC3P19447 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ERCC3P19447 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
ERCC3P19447 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ERCC3P19447 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
ERCC3P19447 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ERCC3P19447 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ERCC3P19447 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ERCC3P19447 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ERCC3P19447 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ERCC3P19447 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ERCC3P19447 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ERCC3P19447 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ERCC3P19447 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ERCC3P19447 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ERCC3P19447 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ERCC3P19447 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ERCC3P19447 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ERCC3P19447 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ERCC3P19447 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ERCC3P19447 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ERCC3P19447 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.6 ms