Protein–RNA interactions for Protein: P18428

LBP, Lipopolysaccharide-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBPP18428 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LBPP18428 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LBPP18428 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LBPP18428 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LBPP18428 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LBPP18428 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LBPP18428 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LBPP18428 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LBPP18428 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LBPP18428 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LBPP18428 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LBPP18428 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LBPP18428 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LBPP18428 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LBPP18428 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LBPP18428 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LBPP18428 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LBPP18428 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LBPP18428 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LBPP18428 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LBPP18428 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LBPP18428 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LBPP18428 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LBPP18428 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LBPP18428 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LBPP18428 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LBPP18428 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LBPP18428 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LBPP18428 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LBPP18428 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LBPP18428 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LBPP18428 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LBPP18428 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LBPP18428 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LBPP18428 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LBPP18428 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LBPP18428 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LBPP18428 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LBPP18428 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LBPP18428 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LBPP18428 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LBPP18428 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LBPP18428 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LBPP18428 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
LBPP18428 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LBPP18428 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LBPP18428 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LBPP18428 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LBPP18428 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LBPP18428 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LBPP18428 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LBPP18428 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LBPP18428 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LBPP18428 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LBPP18428 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LBPP18428 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LBPP18428 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LBPP18428 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LBPP18428 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LBPP18428 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LBPP18428 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LBPP18428 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LBPP18428 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LBPP18428 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LBPP18428 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LBPP18428 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LBPP18428 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LBPP18428 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LBPP18428 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LBPP18428 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LBPP18428 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LBPP18428 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LBPP18428 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LBPP18428 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LBPP18428 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LBPP18428 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LBPP18428 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LBPP18428 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LBPP18428 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LBPP18428 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LBPP18428 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LBPP18428 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LBPP18428 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LBPP18428 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LBPP18428 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LBPP18428 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LBPP18428 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LBPP18428 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LBPP18428 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LBPP18428 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LBPP18428 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LBPP18428 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LBPP18428 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LBPP18428 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LBPP18428 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LBPP18428 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LBPP18428 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LBPP18428 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LBPP18428 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LBPP18428 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms