Protein–RNA interactions for Protein: P16104

H2AFX, Histone H2AX, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFXP16104 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
H2AFXP16104 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
H2AFXP16104 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
H2AFXP16104 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
H2AFXP16104 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
H2AFXP16104 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
H2AFXP16104 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
H2AFXP16104 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
H2AFXP16104 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
H2AFXP16104 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
H2AFXP16104 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
H2AFXP16104 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
H2AFXP16104 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
H2AFXP16104 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
H2AFXP16104 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
H2AFXP16104 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
H2AFXP16104 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
H2AFXP16104 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
H2AFXP16104 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
H2AFXP16104 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
H2AFXP16104 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
H2AFXP16104 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
H2AFXP16104 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
H2AFXP16104 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
H2AFXP16104 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
H2AFXP16104 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
H2AFXP16104 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
H2AFXP16104 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
H2AFXP16104 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
H2AFXP16104 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
H2AFXP16104 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
H2AFXP16104 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
H2AFXP16104 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
H2AFXP16104 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
H2AFXP16104 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
H2AFXP16104 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
H2AFXP16104 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
H2AFXP16104 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
H2AFXP16104 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
H2AFXP16104 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
H2AFXP16104 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
H2AFXP16104 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
H2AFXP16104 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
H2AFXP16104 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
H2AFXP16104 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
H2AFXP16104 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
H2AFXP16104 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
H2AFXP16104 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
H2AFXP16104 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
H2AFXP16104 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
H2AFXP16104 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
H2AFXP16104 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
H2AFXP16104 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
H2AFXP16104 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
H2AFXP16104 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
H2AFXP16104 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
H2AFXP16104 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
H2AFXP16104 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
H2AFXP16104 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
H2AFXP16104 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
H2AFXP16104 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
H2AFXP16104 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
H2AFXP16104 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
H2AFXP16104 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
H2AFXP16104 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
H2AFXP16104 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
H2AFXP16104 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
H2AFXP16104 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
H2AFXP16104 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
H2AFXP16104 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
H2AFXP16104 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
H2AFXP16104 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
H2AFXP16104 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
H2AFXP16104 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
H2AFXP16104 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
H2AFXP16104 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
H2AFXP16104 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
H2AFXP16104 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
H2AFXP16104 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
H2AFXP16104 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
H2AFXP16104 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
H2AFXP16104 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
H2AFXP16104 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
H2AFXP16104 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
H2AFXP16104 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
H2AFXP16104 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
H2AFXP16104 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
H2AFXP16104 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
H2AFXP16104 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
H2AFXP16104 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
H2AFXP16104 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
H2AFXP16104 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
H2AFXP16104 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
H2AFXP16104 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
H2AFXP16104 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
H2AFXP16104 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
H2AFXP16104 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
H2AFXP16104 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
H2AFXP16104 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
H2AFXP16104 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 195.3 ms