Protein–RNA interactions for Protein: P15692

VEGFA, Vascular endothelial growth factor A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFAP15692 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
VEGFAP15692 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
VEGFAP15692 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
VEGFAP15692 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
VEGFAP15692 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
VEGFAP15692 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
VEGFAP15692 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
VEGFAP15692 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
VEGFAP15692 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
VEGFAP15692 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
VEGFAP15692 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
VEGFAP15692 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
VEGFAP15692 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
VEGFAP15692 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
VEGFAP15692 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
VEGFAP15692 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
VEGFAP15692 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
VEGFAP15692 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
VEGFAP15692 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
VEGFAP15692 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
VEGFAP15692 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
VEGFAP15692 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
VEGFAP15692 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
VEGFAP15692 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
VEGFAP15692 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC29■■■□□ 2.23
VEGFAP15692 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
VEGFAP15692 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
VEGFAP15692 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
VEGFAP15692 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
VEGFAP15692 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
VEGFAP15692 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
VEGFAP15692 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
VEGFAP15692 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
VEGFAP15692 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
VEGFAP15692 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
VEGFAP15692 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
VEGFAP15692 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
VEGFAP15692 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
VEGFAP15692 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
VEGFAP15692 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
VEGFAP15692 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
VEGFAP15692 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
VEGFAP15692 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
VEGFAP15692 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
VEGFAP15692 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
VEGFAP15692 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
VEGFAP15692 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
VEGFAP15692 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
VEGFAP15692 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
VEGFAP15692 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
VEGFAP15692 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
VEGFAP15692 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
VEGFAP15692 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
VEGFAP15692 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
VEGFAP15692 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
VEGFAP15692 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
VEGFAP15692 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
VEGFAP15692 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
VEGFAP15692 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
VEGFAP15692 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
VEGFAP15692 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
VEGFAP15692 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
VEGFAP15692 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
VEGFAP15692 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
VEGFAP15692 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
VEGFAP15692 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
VEGFAP15692 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
VEGFAP15692 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
VEGFAP15692 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
VEGFAP15692 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
VEGFAP15692 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
VEGFAP15692 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
VEGFAP15692 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
VEGFAP15692 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
VEGFAP15692 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
VEGFAP15692 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
VEGFAP15692 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
VEGFAP15692 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
VEGFAP15692 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
VEGFAP15692 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
VEGFAP15692 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
VEGFAP15692 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
VEGFAP15692 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
VEGFAP15692 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
VEGFAP15692 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
VEGFAP15692 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
VEGFAP15692 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
VEGFAP15692 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
VEGFAP15692 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
VEGFAP15692 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
VEGFAP15692 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
VEGFAP15692 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
VEGFAP15692 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
VEGFAP15692 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
VEGFAP15692 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
VEGFAP15692 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
VEGFAP15692 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
VEGFAP15692 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
VEGFAP15692 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
VEGFAP15692 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms