Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXB3P14651 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXB3P14651 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXB3P14651 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXB3P14651 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXB3P14651 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXB3P14651 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXB3P14651 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXB3P14651 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXB3P14651 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXB3P14651 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXB3P14651 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXB3P14651 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXB3P14651 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXB3P14651 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXB3P14651 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXB3P14651 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXB3P14651 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXB3P14651 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXB3P14651 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXB3P14651 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXB3P14651 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXB3P14651 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXB3P14651 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXB3P14651 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXB3P14651 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXB3P14651 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXB3P14651 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXB3P14651 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXB3P14651 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXB3P14651 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXB3P14651 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXB3P14651 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXB3P14651 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXB3P14651 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXB3P14651 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXB3P14651 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXB3P14651 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXB3P14651 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXB3P14651 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXB3P14651 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXB3P14651 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXB3P14651 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXB3P14651 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXB3P14651 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXB3P14651 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXB3P14651 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXB3P14651 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXB3P14651 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXB3P14651 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXB3P14651 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXB3P14651 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXB3P14651 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXB3P14651 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HOXB3P14651 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXB3P14651 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXB3P14651 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXB3P14651 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXB3P14651 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXB3P14651 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXB3P14651 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXB3P14651 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXB3P14651 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXB3P14651 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXB3P14651 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXB3P14651 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXB3P14651 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXB3P14651 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXB3P14651 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXB3P14651 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXB3P14651 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXB3P14651 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXB3P14651 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXB3P14651 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXB3P14651 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXB3P14651 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXB3P14651 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXB3P14651 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXB3P14651 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXB3P14651 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXB3P14651 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXB3P14651 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXB3P14651 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXB3P14651 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXB3P14651 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXB3P14651 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXB3P14651 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXB3P14651 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXB3P14651 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXB3P14651 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXB3P14651 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXB3P14651 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXB3P14651 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXB3P14651 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXB3P14651 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXB3P14651 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXB3P14651 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXB3P14651 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXB3P14651 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXB3P14651 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms