Protein–RNA interactions for Protein: P13674

P4HA1, Prolyl 4-hydroxylase subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P4HA1P13674 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
P4HA1P13674 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
P4HA1P13674 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
P4HA1P13674 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
P4HA1P13674 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
P4HA1P13674 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
P4HA1P13674 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
P4HA1P13674 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
P4HA1P13674 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
P4HA1P13674 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
P4HA1P13674 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
P4HA1P13674 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
P4HA1P13674 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
P4HA1P13674 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
P4HA1P13674 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
P4HA1P13674 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
P4HA1P13674 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
P4HA1P13674 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
P4HA1P13674 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
P4HA1P13674 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
P4HA1P13674 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
P4HA1P13674 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
P4HA1P13674 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
P4HA1P13674 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
P4HA1P13674 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
P4HA1P13674 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
P4HA1P13674 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
P4HA1P13674 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
P4HA1P13674 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
P4HA1P13674 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
P4HA1P13674 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
P4HA1P13674 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
P4HA1P13674 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
P4HA1P13674 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
P4HA1P13674 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
P4HA1P13674 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
P4HA1P13674 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
P4HA1P13674 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
P4HA1P13674 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
P4HA1P13674 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
P4HA1P13674 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
P4HA1P13674 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
P4HA1P13674 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
P4HA1P13674 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
P4HA1P13674 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
P4HA1P13674 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
P4HA1P13674 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
P4HA1P13674 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
P4HA1P13674 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
P4HA1P13674 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
P4HA1P13674 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
P4HA1P13674 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
P4HA1P13674 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
P4HA1P13674 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
P4HA1P13674 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
P4HA1P13674 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
P4HA1P13674 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
P4HA1P13674 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
P4HA1P13674 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
P4HA1P13674 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
P4HA1P13674 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
P4HA1P13674 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
P4HA1P13674 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
P4HA1P13674 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
P4HA1P13674 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
P4HA1P13674 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
P4HA1P13674 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
P4HA1P13674 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
P4HA1P13674 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
P4HA1P13674 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
P4HA1P13674 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
P4HA1P13674 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
P4HA1P13674 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
P4HA1P13674 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
P4HA1P13674 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
P4HA1P13674 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
P4HA1P13674 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
P4HA1P13674 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
P4HA1P13674 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
P4HA1P13674 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
P4HA1P13674 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
P4HA1P13674 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
P4HA1P13674 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
P4HA1P13674 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
P4HA1P13674 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
P4HA1P13674 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
P4HA1P13674 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
P4HA1P13674 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
P4HA1P13674 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
P4HA1P13674 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
P4HA1P13674 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
P4HA1P13674 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
P4HA1P13674 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
P4HA1P13674 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
P4HA1P13674 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
P4HA1P13674 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
P4HA1P13674 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
P4HA1P13674 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
P4HA1P13674 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
P4HA1P13674 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms