Protein–RNA interactions for Protein: P12694

BCKDHA, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDHAP12694 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BCKDHAP12694 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BCKDHAP12694 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
BCKDHAP12694 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BCKDHAP12694 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BCKDHAP12694 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BCKDHAP12694 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BCKDHAP12694 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
BCKDHAP12694 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BCKDHAP12694 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BCKDHAP12694 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BCKDHAP12694 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BCKDHAP12694 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BCKDHAP12694 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BCKDHAP12694 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BCKDHAP12694 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BCKDHAP12694 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BCKDHAP12694 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BCKDHAP12694 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BCKDHAP12694 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BCKDHAP12694 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BCKDHAP12694 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
BCKDHAP12694 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BCKDHAP12694 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BCKDHAP12694 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BCKDHAP12694 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BCKDHAP12694 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BCKDHAP12694 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BCKDHAP12694 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BCKDHAP12694 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BCKDHAP12694 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
BCKDHAP12694 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
BCKDHAP12694 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BCKDHAP12694 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BCKDHAP12694 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BCKDHAP12694 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
BCKDHAP12694 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BCKDHAP12694 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BCKDHAP12694 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BCKDHAP12694 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BCKDHAP12694 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BCKDHAP12694 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BCKDHAP12694 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BCKDHAP12694 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BCKDHAP12694 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BCKDHAP12694 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BCKDHAP12694 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BCKDHAP12694 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BCKDHAP12694 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BCKDHAP12694 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BCKDHAP12694 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BCKDHAP12694 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BCKDHAP12694 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BCKDHAP12694 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BCKDHAP12694 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BCKDHAP12694 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BCKDHAP12694 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BCKDHAP12694 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BCKDHAP12694 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BCKDHAP12694 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BCKDHAP12694 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BCKDHAP12694 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BCKDHAP12694 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BCKDHAP12694 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BCKDHAP12694 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BCKDHAP12694 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BCKDHAP12694 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BCKDHAP12694 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BCKDHAP12694 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BCKDHAP12694 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BCKDHAP12694 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BCKDHAP12694 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
BCKDHAP12694 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BCKDHAP12694 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BCKDHAP12694 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BCKDHAP12694 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BCKDHAP12694 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BCKDHAP12694 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BCKDHAP12694 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BCKDHAP12694 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BCKDHAP12694 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BCKDHAP12694 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BCKDHAP12694 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BCKDHAP12694 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BCKDHAP12694 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BCKDHAP12694 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BCKDHAP12694 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BCKDHAP12694 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BCKDHAP12694 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BCKDHAP12694 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BCKDHAP12694 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BCKDHAP12694 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
BCKDHAP12694 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BCKDHAP12694 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BCKDHAP12694 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BCKDHAP12694 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BCKDHAP12694 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BCKDHAP12694 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCKDHAP12694 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
BCKDHAP12694 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.7 ms