Protein–RNA interactions for Protein: P11712

CYP2C9, Cytochrome P450 2C9, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP2C9P11712 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CYP2C9P11712 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CYP2C9P11712 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CYP2C9P11712 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CYP2C9P11712 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CYP2C9P11712 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CYP2C9P11712 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CYP2C9P11712 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CYP2C9P11712 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CYP2C9P11712 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CYP2C9P11712 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CYP2C9P11712 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CYP2C9P11712 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CYP2C9P11712 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CYP2C9P11712 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CYP2C9P11712 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CYP2C9P11712 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CYP2C9P11712 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CYP2C9P11712 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CYP2C9P11712 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CYP2C9P11712 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CYP2C9P11712 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CYP2C9P11712 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CYP2C9P11712 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CYP2C9P11712 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CYP2C9P11712 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CYP2C9P11712 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CYP2C9P11712 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CYP2C9P11712 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CYP2C9P11712 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CYP2C9P11712 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CYP2C9P11712 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CYP2C9P11712 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CYP2C9P11712 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CYP2C9P11712 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CYP2C9P11712 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CYP2C9P11712 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CYP2C9P11712 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CYP2C9P11712 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CYP2C9P11712 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CYP2C9P11712 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CYP2C9P11712 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CYP2C9P11712 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CYP2C9P11712 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CYP2C9P11712 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CYP2C9P11712 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CYP2C9P11712 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CYP2C9P11712 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CYP2C9P11712 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CYP2C9P11712 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CYP2C9P11712 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CYP2C9P11712 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CYP2C9P11712 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CYP2C9P11712 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CYP2C9P11712 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CYP2C9P11712 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CYP2C9P11712 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CYP2C9P11712 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CYP2C9P11712 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CYP2C9P11712 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CYP2C9P11712 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CYP2C9P11712 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CYP2C9P11712 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CYP2C9P11712 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CYP2C9P11712 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CYP2C9P11712 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CYP2C9P11712 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CYP2C9P11712 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CYP2C9P11712 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CYP2C9P11712 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CYP2C9P11712 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CYP2C9P11712 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CYP2C9P11712 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CYP2C9P11712 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CYP2C9P11712 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CYP2C9P11712 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CYP2C9P11712 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CYP2C9P11712 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CYP2C9P11712 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CYP2C9P11712 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CYP2C9P11712 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CYP2C9P11712 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CYP2C9P11712 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CYP2C9P11712 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CYP2C9P11712 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CYP2C9P11712 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CYP2C9P11712 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CYP2C9P11712 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CYP2C9P11712 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CYP2C9P11712 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CYP2C9P11712 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CYP2C9P11712 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CYP2C9P11712 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CYP2C9P11712 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CYP2C9P11712 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CYP2C9P11712 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CYP2C9P11712 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CYP2C9P11712 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CYP2C9P11712 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CYP2C9P11712 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms