Protein–RNA interactions for Protein: P10966

CD8B, T-cell surface glycoprotein CD8 beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8BP10966 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD8BP10966 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD8BP10966 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD8BP10966 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD8BP10966 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD8BP10966 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD8BP10966 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD8BP10966 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD8BP10966 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD8BP10966 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD8BP10966 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD8BP10966 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD8BP10966 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD8BP10966 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD8BP10966 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD8BP10966 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD8BP10966 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD8BP10966 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD8BP10966 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CD8BP10966 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD8BP10966 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD8BP10966 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD8BP10966 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD8BP10966 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD8BP10966 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD8BP10966 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD8BP10966 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD8BP10966 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD8BP10966 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD8BP10966 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD8BP10966 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD8BP10966 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CD8BP10966 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CD8BP10966 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CD8BP10966 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD8BP10966 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD8BP10966 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CD8BP10966 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD8BP10966 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD8BP10966 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD8BP10966 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD8BP10966 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD8BP10966 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD8BP10966 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD8BP10966 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD8BP10966 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CD8BP10966 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD8BP10966 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD8BP10966 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD8BP10966 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD8BP10966 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CD8BP10966 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD8BP10966 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD8BP10966 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD8BP10966 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD8BP10966 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD8BP10966 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD8BP10966 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD8BP10966 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD8BP10966 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD8BP10966 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD8BP10966 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD8BP10966 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD8BP10966 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD8BP10966 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD8BP10966 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD8BP10966 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD8BP10966 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD8BP10966 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD8BP10966 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD8BP10966 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD8BP10966 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD8BP10966 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD8BP10966 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD8BP10966 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD8BP10966 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD8BP10966 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD8BP10966 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD8BP10966 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD8BP10966 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD8BP10966 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD8BP10966 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD8BP10966 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD8BP10966 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD8BP10966 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD8BP10966 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD8BP10966 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD8BP10966 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD8BP10966 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD8BP10966 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD8BP10966 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD8BP10966 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD8BP10966 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD8BP10966 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD8BP10966 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD8BP10966 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD8BP10966 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD8BP10966 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD8BP10966 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD8BP10966 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms