Protein–RNA interactions for Protein: P10619

CTSA, Lysosomal protective protein, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSAP10619 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTSAP10619 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTSAP10619 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTSAP10619 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CTSAP10619 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTSAP10619 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTSAP10619 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTSAP10619 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTSAP10619 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTSAP10619 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTSAP10619 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTSAP10619 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTSAP10619 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTSAP10619 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTSAP10619 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTSAP10619 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTSAP10619 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTSAP10619 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTSAP10619 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTSAP10619 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTSAP10619 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTSAP10619 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTSAP10619 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTSAP10619 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTSAP10619 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CTSAP10619 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTSAP10619 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTSAP10619 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTSAP10619 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTSAP10619 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTSAP10619 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTSAP10619 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTSAP10619 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTSAP10619 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTSAP10619 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTSAP10619 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTSAP10619 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CTSAP10619 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CTSAP10619 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTSAP10619 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTSAP10619 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTSAP10619 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTSAP10619 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTSAP10619 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTSAP10619 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTSAP10619 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTSAP10619 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTSAP10619 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTSAP10619 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CTSAP10619 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTSAP10619 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTSAP10619 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTSAP10619 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTSAP10619 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTSAP10619 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CTSAP10619 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTSAP10619 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTSAP10619 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTSAP10619 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTSAP10619 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTSAP10619 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CTSAP10619 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTSAP10619 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTSAP10619 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTSAP10619 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTSAP10619 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTSAP10619 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTSAP10619 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTSAP10619 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTSAP10619 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTSAP10619 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTSAP10619 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTSAP10619 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTSAP10619 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTSAP10619 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTSAP10619 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTSAP10619 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTSAP10619 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CTSAP10619 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTSAP10619 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTSAP10619 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTSAP10619 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTSAP10619 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTSAP10619 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTSAP10619 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CTSAP10619 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTSAP10619 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTSAP10619 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTSAP10619 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTSAP10619 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTSAP10619 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTSAP10619 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTSAP10619 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTSAP10619 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTSAP10619 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTSAP10619 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTSAP10619 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTSAP10619 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTSAP10619 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CTSAP10619 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms