Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW4

SMIM10L2A, Small integral membrane protein 10-like protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L2AP0DMW4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMIM10L2AP0DMW4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMIM10L2AP0DMW4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMIM10L2AP0DMW4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMIM10L2AP0DMW4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMIM10L2AP0DMW4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SMIM10L2AP0DMW4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMIM10L2AP0DMW4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMIM10L2AP0DMW4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMIM10L2AP0DMW4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMIM10L2AP0DMW4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMIM10L2AP0DMW4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMIM10L2AP0DMW4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMIM10L2AP0DMW4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMIM10L2AP0DMW4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMIM10L2AP0DMW4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMIM10L2AP0DMW4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMIM10L2AP0DMW4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMIM10L2AP0DMW4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMIM10L2AP0DMW4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMIM10L2AP0DMW4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SMIM10L2AP0DMW4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMIM10L2AP0DMW4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMIM10L2AP0DMW4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMIM10L2AP0DMW4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMIM10L2AP0DMW4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMIM10L2AP0DMW4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMIM10L2AP0DMW4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMIM10L2AP0DMW4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMIM10L2AP0DMW4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMIM10L2AP0DMW4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMIM10L2AP0DMW4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMIM10L2AP0DMW4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMIM10L2AP0DMW4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMIM10L2AP0DMW4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMIM10L2AP0DMW4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SMIM10L2AP0DMW4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SMIM10L2AP0DMW4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SMIM10L2AP0DMW4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SMIM10L2AP0DMW4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SMIM10L2AP0DMW4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SMIM10L2AP0DMW4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SMIM10L2AP0DMW4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SMIM10L2AP0DMW4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SMIM10L2AP0DMW4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMIM10L2AP0DMW4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMIM10L2AP0DMW4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMIM10L2AP0DMW4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMIM10L2AP0DMW4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMIM10L2AP0DMW4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMIM10L2AP0DMW4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMIM10L2AP0DMW4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMIM10L2AP0DMW4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMIM10L2AP0DMW4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMIM10L2AP0DMW4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMIM10L2AP0DMW4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMIM10L2AP0DMW4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMIM10L2AP0DMW4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMIM10L2AP0DMW4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMIM10L2AP0DMW4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMIM10L2AP0DMW4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMIM10L2AP0DMW4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMIM10L2AP0DMW4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMIM10L2AP0DMW4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMIM10L2AP0DMW4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SMIM10L2AP0DMW4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMIM10L2AP0DMW4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMIM10L2AP0DMW4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMIM10L2AP0DMW4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SMIM10L2AP0DMW4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMIM10L2AP0DMW4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMIM10L2AP0DMW4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMIM10L2AP0DMW4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMIM10L2AP0DMW4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMIM10L2AP0DMW4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMIM10L2AP0DMW4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMIM10L2AP0DMW4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SMIM10L2AP0DMW4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SMIM10L2AP0DMW4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SMIM10L2AP0DMW4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SMIM10L2AP0DMW4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMIM10L2AP0DMW4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMIM10L2AP0DMW4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SMIM10L2AP0DMW4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMIM10L2AP0DMW4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMIM10L2AP0DMW4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMIM10L2AP0DMW4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMIM10L2AP0DMW4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMIM10L2AP0DMW4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMIM10L2AP0DMW4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SMIM10L2AP0DMW4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SMIM10L2AP0DMW4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SMIM10L2AP0DMW4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SMIM10L2AP0DMW4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SMIM10L2AP0DMW4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SMIM10L2AP0DMW4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SMIM10L2AP0DMW4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMIM10L2AP0DMW4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMIM10L2AP0DMW4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMIM10L2AP0DMW4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms