Protein–RNA interactions for Protein: P0DMP2

SRGAP2B, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2BP0DMP2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRGAP2BP0DMP2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRGAP2BP0DMP2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRGAP2BP0DMP2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRGAP2BP0DMP2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SRGAP2BP0DMP2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SRGAP2BP0DMP2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SRGAP2BP0DMP2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SRGAP2BP0DMP2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SRGAP2BP0DMP2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRGAP2BP0DMP2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRGAP2BP0DMP2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRGAP2BP0DMP2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRGAP2BP0DMP2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRGAP2BP0DMP2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRGAP2BP0DMP2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRGAP2BP0DMP2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRGAP2BP0DMP2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRGAP2BP0DMP2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRGAP2BP0DMP2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SRGAP2BP0DMP2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SRGAP2BP0DMP2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRGAP2BP0DMP2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRGAP2BP0DMP2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRGAP2BP0DMP2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRGAP2BP0DMP2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRGAP2BP0DMP2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRGAP2BP0DMP2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRGAP2BP0DMP2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRGAP2BP0DMP2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRGAP2BP0DMP2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRGAP2BP0DMP2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRGAP2BP0DMP2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRGAP2BP0DMP2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRGAP2BP0DMP2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRGAP2BP0DMP2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRGAP2BP0DMP2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRGAP2BP0DMP2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRGAP2BP0DMP2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRGAP2BP0DMP2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SRGAP2BP0DMP2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SRGAP2BP0DMP2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SRGAP2BP0DMP2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SRGAP2BP0DMP2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SRGAP2BP0DMP2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SRGAP2BP0DMP2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SRGAP2BP0DMP2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SRGAP2BP0DMP2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRGAP2BP0DMP2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRGAP2BP0DMP2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRGAP2BP0DMP2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRGAP2BP0DMP2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRGAP2BP0DMP2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRGAP2BP0DMP2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SRGAP2BP0DMP2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SRGAP2BP0DMP2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SRGAP2BP0DMP2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SRGAP2BP0DMP2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SRGAP2BP0DMP2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SRGAP2BP0DMP2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRGAP2BP0DMP2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRGAP2BP0DMP2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRGAP2BP0DMP2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRGAP2BP0DMP2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRGAP2BP0DMP2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRGAP2BP0DMP2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRGAP2BP0DMP2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRGAP2BP0DMP2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRGAP2BP0DMP2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRGAP2BP0DMP2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRGAP2BP0DMP2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRGAP2BP0DMP2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRGAP2BP0DMP2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRGAP2BP0DMP2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRGAP2BP0DMP2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SRGAP2BP0DMP2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRGAP2BP0DMP2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRGAP2BP0DMP2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRGAP2BP0DMP2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRGAP2BP0DMP2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRGAP2BP0DMP2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRGAP2BP0DMP2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRGAP2BP0DMP2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRGAP2BP0DMP2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRGAP2BP0DMP2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRGAP2BP0DMP2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRGAP2BP0DMP2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRGAP2BP0DMP2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRGAP2BP0DMP2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRGAP2BP0DMP2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRGAP2BP0DMP2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRGAP2BP0DMP2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRGAP2BP0DMP2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SRGAP2BP0DMP2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRGAP2BP0DMP2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRGAP2BP0DMP2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRGAP2BP0DMP2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRGAP2BP0DMP2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRGAP2BP0DMP2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRGAP2BP0DMP2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms