Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
RGPD2P0DJD1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
RGPD2P0DJD1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
RGPD2P0DJD1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
RGPD2P0DJD1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC31.6■■■□□ 2.65
RGPD2P0DJD1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
RGPD2P0DJD1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
RGPD2P0DJD1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
RGPD2P0DJD1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
RGPD2P0DJD1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
RGPD2P0DJD1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
RGPD2P0DJD1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
RGPD2P0DJD1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
RGPD2P0DJD1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC31.58■■■□□ 2.65
RGPD2P0DJD1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
RGPD2P0DJD1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
RGPD2P0DJD1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
RGPD2P0DJD1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
RGPD2P0DJD1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
RGPD2P0DJD1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
RGPD2P0DJD1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
RGPD2P0DJD1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
RGPD2P0DJD1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
RGPD2P0DJD1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
RGPD2P0DJD1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
RGPD2P0DJD1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
RGPD2P0DJD1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
RGPD2P0DJD1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
RGPD2P0DJD1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
RGPD2P0DJD1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
RGPD2P0DJD1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
RGPD2P0DJD1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
RGPD2P0DJD1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
RGPD2P0DJD1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
RGPD2P0DJD1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
RGPD2P0DJD1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
RGPD2P0DJD1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
RGPD2P0DJD1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
RGPD2P0DJD1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
RGPD2P0DJD1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
RGPD2P0DJD1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
RGPD2P0DJD1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
RGPD2P0DJD1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC31.53■■■□□ 2.64
RGPD2P0DJD1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC31.53■■■□□ 2.64
RGPD2P0DJD1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
RGPD2P0DJD1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
RGPD2P0DJD1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
RGPD2P0DJD1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
RGPD2P0DJD1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
RGPD2P0DJD1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
RGPD2P0DJD1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
RGPD2P0DJD1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
RGPD2P0DJD1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
RGPD2P0DJD1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
RGPD2P0DJD1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC31.51■■■□□ 2.64
RGPD2P0DJD1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC31.51■■■□□ 2.64
RGPD2P0DJD1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
RGPD2P0DJD1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
RGPD2P0DJD1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
RGPD2P0DJD1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
RGPD2P0DJD1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
RGPD2P0DJD1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
RGPD2P0DJD1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
RGPD2P0DJD1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
RGPD2P0DJD1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
RGPD2P0DJD1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
RGPD2P0DJD1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
RGPD2P0DJD1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC31.48■■■□□ 2.63
RGPD2P0DJD1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
RGPD2P0DJD1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
RGPD2P0DJD1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
RGPD2P0DJD1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
RGPD2P0DJD1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
RGPD2P0DJD1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC31.46■■■□□ 2.63
RGPD2P0DJD1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
RGPD2P0DJD1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
RGPD2P0DJD1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
RGPD2P0DJD1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
RGPD2P0DJD1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
RGPD2P0DJD1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.63
RGPD2P0DJD1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
RGPD2P0DJD1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
RGPD2P0DJD1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
RGPD2P0DJD1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
RGPD2P0DJD1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
RGPD2P0DJD1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
RGPD2P0DJD1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
RGPD2P0DJD1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
RGPD2P0DJD1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
RGPD2P0DJD1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
RGPD2P0DJD1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
RGPD2P0DJD1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
RGPD2P0DJD1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
RGPD2P0DJD1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC31.42■■■□□ 2.62
RGPD2P0DJD1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC31.42■■■□□ 2.62
RGPD2P0DJD1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
RGPD2P0DJD1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
RGPD2P0DJD1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
RGPD2P0DJD1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
RGPD2P0DJD1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms