Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC172P0C7W6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC172P0C7W6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC172P0C7W6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC172P0C7W6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC172P0C7W6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC172P0C7W6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC172P0C7W6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC172P0C7W6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC172P0C7W6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC172P0C7W6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC172P0C7W6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC172P0C7W6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC172P0C7W6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC172P0C7W6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC172P0C7W6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC172P0C7W6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC172P0C7W6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC172P0C7W6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC172P0C7W6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC172P0C7W6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC172P0C7W6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC172P0C7W6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC172P0C7W6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC172P0C7W6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC172P0C7W6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC172P0C7W6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC172P0C7W6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC172P0C7W6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC172P0C7W6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC172P0C7W6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC172P0C7W6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC172P0C7W6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC172P0C7W6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC172P0C7W6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC172P0C7W6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC172P0C7W6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC172P0C7W6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC172P0C7W6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC172P0C7W6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC172P0C7W6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC172P0C7W6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC172P0C7W6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC172P0C7W6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC172P0C7W6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC172P0C7W6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC172P0C7W6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC172P0C7W6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC172P0C7W6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC172P0C7W6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC172P0C7W6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC172P0C7W6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC172P0C7W6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC172P0C7W6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC172P0C7W6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC172P0C7W6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC172P0C7W6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC172P0C7W6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC172P0C7W6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC172P0C7W6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC172P0C7W6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC172P0C7W6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC172P0C7W6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC172P0C7W6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC172P0C7W6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC172P0C7W6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC172P0C7W6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC172P0C7W6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC172P0C7W6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC172P0C7W6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC172P0C7W6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC172P0C7W6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC172P0C7W6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC172P0C7W6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC172P0C7W6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC172P0C7W6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC172P0C7W6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC172P0C7W6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC172P0C7W6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC172P0C7W6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC172P0C7W6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC172P0C7W6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC172P0C7W6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC172P0C7W6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC172P0C7W6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC172P0C7W6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC172P0C7W6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC172P0C7W6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC172P0C7W6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC172P0C7W6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC172P0C7W6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC172P0C7W6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC172P0C7W6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC172P0C7W6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC172P0C7W6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC172P0C7W6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC172P0C7W6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC172P0C7W6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC172P0C7W6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC172P0C7W6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms