Protein–RNA interactions for Protein: P09110

ACAA1, 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA1P09110 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACAA1P09110 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACAA1P09110 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACAA1P09110 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACAA1P09110 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACAA1P09110 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACAA1P09110 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACAA1P09110 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACAA1P09110 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACAA1P09110 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACAA1P09110 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACAA1P09110 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACAA1P09110 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACAA1P09110 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACAA1P09110 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ACAA1P09110 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACAA1P09110 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACAA1P09110 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACAA1P09110 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACAA1P09110 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACAA1P09110 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ACAA1P09110 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACAA1P09110 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ACAA1P09110 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACAA1P09110 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACAA1P09110 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
ACAA1P09110 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACAA1P09110 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACAA1P09110 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACAA1P09110 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
ACAA1P09110 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACAA1P09110 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACAA1P09110 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACAA1P09110 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACAA1P09110 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACAA1P09110 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACAA1P09110 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACAA1P09110 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACAA1P09110 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACAA1P09110 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACAA1P09110 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACAA1P09110 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ACAA1P09110 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACAA1P09110 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ACAA1P09110 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACAA1P09110 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACAA1P09110 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACAA1P09110 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACAA1P09110 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACAA1P09110 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACAA1P09110 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACAA1P09110 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACAA1P09110 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACAA1P09110 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACAA1P09110 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACAA1P09110 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACAA1P09110 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACAA1P09110 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACAA1P09110 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACAA1P09110 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACAA1P09110 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACAA1P09110 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACAA1P09110 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACAA1P09110 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACAA1P09110 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACAA1P09110 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACAA1P09110 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACAA1P09110 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACAA1P09110 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACAA1P09110 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACAA1P09110 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACAA1P09110 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACAA1P09110 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACAA1P09110 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACAA1P09110 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACAA1P09110 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACAA1P09110 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACAA1P09110 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACAA1P09110 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACAA1P09110 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACAA1P09110 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACAA1P09110 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACAA1P09110 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACAA1P09110 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACAA1P09110 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACAA1P09110 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACAA1P09110 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ACAA1P09110 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACAA1P09110 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ACAA1P09110 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACAA1P09110 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACAA1P09110 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACAA1P09110 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ACAA1P09110 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ACAA1P09110 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ACAA1P09110 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACAA1P09110 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACAA1P09110 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACAA1P09110 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACAA1P09110 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms