Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTPRCP08575 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTPRCP08575 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTPRCP08575 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTPRCP08575 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTPRCP08575 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTPRCP08575 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTPRCP08575 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTPRCP08575 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTPRCP08575 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTPRCP08575 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTPRCP08575 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PTPRCP08575 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PTPRCP08575 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PTPRCP08575 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PTPRCP08575 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PTPRCP08575 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PTPRCP08575 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PTPRCP08575 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PTPRCP08575 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PTPRCP08575 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PTPRCP08575 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PTPRCP08575 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PTPRCP08575 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
PTPRCP08575 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PTPRCP08575 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PTPRCP08575 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PTPRCP08575 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
PTPRCP08575 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
PTPRCP08575 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PTPRCP08575 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PTPRCP08575 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PTPRCP08575 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PTPRCP08575 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
PTPRCP08575 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PTPRCP08575 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PTPRCP08575 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PTPRCP08575 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PTPRCP08575 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PTPRCP08575 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
PTPRCP08575 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTPRCP08575 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTPRCP08575 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTPRCP08575 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTPRCP08575 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTPRCP08575 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTPRCP08575 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTPRCP08575 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTPRCP08575 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PTPRCP08575 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PTPRCP08575 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PTPRCP08575 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PTPRCP08575 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PTPRCP08575 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PTPRCP08575 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PTPRCP08575 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PTPRCP08575 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PTPRCP08575 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PTPRCP08575 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PTPRCP08575 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
PTPRCP08575 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PTPRCP08575 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTPRCP08575 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTPRCP08575 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTPRCP08575 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTPRCP08575 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTPRCP08575 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTPRCP08575 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTPRCP08575 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTPRCP08575 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
PTPRCP08575 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
PTPRCP08575 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
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PTPRCP08575 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
PTPRCP08575 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PTPRCP08575 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PTPRCP08575 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PTPRCP08575 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PTPRCP08575 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PTPRCP08575 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PTPRCP08575 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PTPRCP08575 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PTPRCP08575 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PTPRCP08575 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PTPRCP08575 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
PTPRCP08575 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PTPRCP08575 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PTPRCP08575 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PTPRCP08575 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
PTPRCP08575 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PTPRCP08575 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
PTPRCP08575 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PTPRCP08575 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PTPRCP08575 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
PTPRCP08575 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PTPRCP08575 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PTPRCP08575 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PTPRCP08575 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PTPRCP08575 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PTPRCP08575 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
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