Protein–RNA interactions for Protein: P02748

C9, Complement component C9, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9P02748 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C9P02748 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C9P02748 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
C9P02748 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
C9P02748 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
C9P02748 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C9P02748 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C9P02748 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C9P02748 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
C9P02748 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C9P02748 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C9P02748 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C9P02748 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C9P02748 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C9P02748 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C9P02748 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C9P02748 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C9P02748 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C9P02748 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C9P02748 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C9P02748 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C9P02748 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C9P02748 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C9P02748 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C9P02748 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C9P02748 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
C9P02748 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C9P02748 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C9P02748 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C9P02748 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C9P02748 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C9P02748 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C9P02748 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C9P02748 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C9P02748 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C9P02748 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C9P02748 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C9P02748 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C9P02748 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
C9P02748 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C9P02748 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C9P02748 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C9P02748 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C9P02748 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C9P02748 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C9P02748 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C9P02748 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
C9P02748 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C9P02748 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C9P02748 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C9P02748 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C9P02748 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C9P02748 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C9P02748 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C9P02748 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
C9P02748 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C9P02748 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C9P02748 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
C9P02748 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C9P02748 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C9P02748 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C9P02748 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C9P02748 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C9P02748 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C9P02748 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C9P02748 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C9P02748 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C9P02748 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C9P02748 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
C9P02748 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C9P02748 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C9P02748 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C9P02748 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C9P02748 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C9P02748 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C9P02748 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C9P02748 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C9P02748 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C9P02748 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C9P02748 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C9P02748 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C9P02748 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C9P02748 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C9P02748 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C9P02748 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C9P02748 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C9P02748 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
C9P02748 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C9P02748 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C9P02748 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C9P02748 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C9P02748 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C9P02748 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
C9P02748 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
C9P02748 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C9P02748 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C9P02748 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C9P02748 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C9P02748 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C9P02748 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms