Protein–RNA interactions for Protein: P00338

LDHA, L-lactate dehydrogenase A chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDHAP00338 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LDHAP00338 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LDHAP00338 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LDHAP00338 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LDHAP00338 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LDHAP00338 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LDHAP00338 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LDHAP00338 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LDHAP00338 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LDHAP00338 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LDHAP00338 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LDHAP00338 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LDHAP00338 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LDHAP00338 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LDHAP00338 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LDHAP00338 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LDHAP00338 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LDHAP00338 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LDHAP00338 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LDHAP00338 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LDHAP00338 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LDHAP00338 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LDHAP00338 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LDHAP00338 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LDHAP00338 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LDHAP00338 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
LDHAP00338 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LDHAP00338 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LDHAP00338 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LDHAP00338 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LDHAP00338 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LDHAP00338 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
LDHAP00338 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
LDHAP00338 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LDHAP00338 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LDHAP00338 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LDHAP00338 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LDHAP00338 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LDHAP00338 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LDHAP00338 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LDHAP00338 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LDHAP00338 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LDHAP00338 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LDHAP00338 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LDHAP00338 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LDHAP00338 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LDHAP00338 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LDHAP00338 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LDHAP00338 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LDHAP00338 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LDHAP00338 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LDHAP00338 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LDHAP00338 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LDHAP00338 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LDHAP00338 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LDHAP00338 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
LDHAP00338 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LDHAP00338 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LDHAP00338 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LDHAP00338 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LDHAP00338 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LDHAP00338 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LDHAP00338 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LDHAP00338 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LDHAP00338 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LDHAP00338 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LDHAP00338 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LDHAP00338 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LDHAP00338 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LDHAP00338 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LDHAP00338 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LDHAP00338 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LDHAP00338 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LDHAP00338 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LDHAP00338 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LDHAP00338 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LDHAP00338 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LDHAP00338 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LDHAP00338 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LDHAP00338 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
LDHAP00338 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LDHAP00338 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LDHAP00338 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LDHAP00338 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LDHAP00338 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LDHAP00338 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LDHAP00338 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LDHAP00338 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LDHAP00338 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LDHAP00338 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LDHAP00338 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LDHAP00338 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
LDHAP00338 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LDHAP00338 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LDHAP00338 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LDHAP00338 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LDHAP00338 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LDHAP00338 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LDHAP00338 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LDHAP00338 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms