Protein–RNA interactions for Protein: O96005

CLPTM1, Cleft lip and palate transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPTM1O96005 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLPTM1O96005 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLPTM1O96005 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLPTM1O96005 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLPTM1O96005 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLPTM1O96005 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLPTM1O96005 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLPTM1O96005 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLPTM1O96005 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLPTM1O96005 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLPTM1O96005 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLPTM1O96005 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLPTM1O96005 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLPTM1O96005 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLPTM1O96005 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLPTM1O96005 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLPTM1O96005 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLPTM1O96005 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CLPTM1O96005 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLPTM1O96005 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLPTM1O96005 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLPTM1O96005 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLPTM1O96005 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLPTM1O96005 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLPTM1O96005 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLPTM1O96005 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLPTM1O96005 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLPTM1O96005 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLPTM1O96005 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLPTM1O96005 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLPTM1O96005 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLPTM1O96005 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLPTM1O96005 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLPTM1O96005 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLPTM1O96005 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLPTM1O96005 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLPTM1O96005 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLPTM1O96005 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLPTM1O96005 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLPTM1O96005 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLPTM1O96005 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLPTM1O96005 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLPTM1O96005 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CLPTM1O96005 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLPTM1O96005 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLPTM1O96005 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLPTM1O96005 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLPTM1O96005 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLPTM1O96005 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLPTM1O96005 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLPTM1O96005 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLPTM1O96005 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLPTM1O96005 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLPTM1O96005 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLPTM1O96005 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLPTM1O96005 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLPTM1O96005 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLPTM1O96005 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLPTM1O96005 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLPTM1O96005 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLPTM1O96005 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLPTM1O96005 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLPTM1O96005 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLPTM1O96005 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CLPTM1O96005 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CLPTM1O96005 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CLPTM1O96005 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CLPTM1O96005 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CLPTM1O96005 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CLPTM1O96005 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CLPTM1O96005 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CLPTM1O96005 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CLPTM1O96005 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLPTM1O96005 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLPTM1O96005 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLPTM1O96005 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLPTM1O96005 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLPTM1O96005 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLPTM1O96005 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CLPTM1O96005 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLPTM1O96005 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLPTM1O96005 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLPTM1O96005 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLPTM1O96005 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLPTM1O96005 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLPTM1O96005 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CLPTM1O96005 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLPTM1O96005 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLPTM1O96005 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLPTM1O96005 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLPTM1O96005 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLPTM1O96005 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLPTM1O96005 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CLPTM1O96005 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CLPTM1O96005 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLPTM1O96005 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLPTM1O96005 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLPTM1O96005 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CLPTM1O96005 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLPTM1O96005 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms