Protein–RNA interactions for Protein: O95476

CTDNEP1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1O95476 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CTDNEP1O95476 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CTDNEP1O95476 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CTDNEP1O95476 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CTDNEP1O95476 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CTDNEP1O95476 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CTDNEP1O95476 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CTDNEP1O95476 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CTDNEP1O95476 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CTDNEP1O95476 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CTDNEP1O95476 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CTDNEP1O95476 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CTDNEP1O95476 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CTDNEP1O95476 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CTDNEP1O95476 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CTDNEP1O95476 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CTDNEP1O95476 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CTDNEP1O95476 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CTDNEP1O95476 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CTDNEP1O95476 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CTDNEP1O95476 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CTDNEP1O95476 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CTDNEP1O95476 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CTDNEP1O95476 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CTDNEP1O95476 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CTDNEP1O95476 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CTDNEP1O95476 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CTDNEP1O95476 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CTDNEP1O95476 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CTDNEP1O95476 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CTDNEP1O95476 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CTDNEP1O95476 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CTDNEP1O95476 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CTDNEP1O95476 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CTDNEP1O95476 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CTDNEP1O95476 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CTDNEP1O95476 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CTDNEP1O95476 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CTDNEP1O95476 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CTDNEP1O95476 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CTDNEP1O95476 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CTDNEP1O95476 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CTDNEP1O95476 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CTDNEP1O95476 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CTDNEP1O95476 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CTDNEP1O95476 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CTDNEP1O95476 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CTDNEP1O95476 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CTDNEP1O95476 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CTDNEP1O95476 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CTDNEP1O95476 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CTDNEP1O95476 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CTDNEP1O95476 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CTDNEP1O95476 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CTDNEP1O95476 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CTDNEP1O95476 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CTDNEP1O95476 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CTDNEP1O95476 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CTDNEP1O95476 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CTDNEP1O95476 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CTDNEP1O95476 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CTDNEP1O95476 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CTDNEP1O95476 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CTDNEP1O95476 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CTDNEP1O95476 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CTDNEP1O95476 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CTDNEP1O95476 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CTDNEP1O95476 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CTDNEP1O95476 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CTDNEP1O95476 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CTDNEP1O95476 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CTDNEP1O95476 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CTDNEP1O95476 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CTDNEP1O95476 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CTDNEP1O95476 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CTDNEP1O95476 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CTDNEP1O95476 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CTDNEP1O95476 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CTDNEP1O95476 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CTDNEP1O95476 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CTDNEP1O95476 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CTDNEP1O95476 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CTDNEP1O95476 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CTDNEP1O95476 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CTDNEP1O95476 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CTDNEP1O95476 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CTDNEP1O95476 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CTDNEP1O95476 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CTDNEP1O95476 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CTDNEP1O95476 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CTDNEP1O95476 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CTDNEP1O95476 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CTDNEP1O95476 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CTDNEP1O95476 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CTDNEP1O95476 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CTDNEP1O95476 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CTDNEP1O95476 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CTDNEP1O95476 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CTDNEP1O95476 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CTDNEP1O95476 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms