Protein–RNA interactions for Protein: O95398

RAPGEF3, Rap guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF3O95398 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC36.24■■■■□ 3.39
RAPGEF3O95398 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
RAPGEF3O95398 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
RAPGEF3O95398 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
RAPGEF3O95398 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
RAPGEF3O95398 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
RAPGEF3O95398 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
RAPGEF3O95398 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
RAPGEF3O95398 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
RAPGEF3O95398 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
RAPGEF3O95398 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
RAPGEF3O95398 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
RAPGEF3O95398 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
RAPGEF3O95398 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
RAPGEF3O95398 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
RAPGEF3O95398 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
RAPGEF3O95398 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC36.21■■■■□ 3.39
RAPGEF3O95398 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
RAPGEF3O95398 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
RAPGEF3O95398 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
RAPGEF3O95398 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
RAPGEF3O95398 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
RAPGEF3O95398 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
RAPGEF3O95398 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
RAPGEF3O95398 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
RAPGEF3O95398 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
RAPGEF3O95398 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
RAPGEF3O95398 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
RAPGEF3O95398 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
RAPGEF3O95398 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
RAPGEF3O95398 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
RAPGEF3O95398 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
RAPGEF3O95398 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
RAPGEF3O95398 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
RAPGEF3O95398 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
RAPGEF3O95398 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
RAPGEF3O95398 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
RAPGEF3O95398 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
RAPGEF3O95398 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
RAPGEF3O95398 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
RAPGEF3O95398 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
RAPGEF3O95398 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
RAPGEF3O95398 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
RAPGEF3O95398 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
RAPGEF3O95398 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
RAPGEF3O95398 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
RAPGEF3O95398 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
RAPGEF3O95398 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
RAPGEF3O95398 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
RAPGEF3O95398 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
RAPGEF3O95398 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
RAPGEF3O95398 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
RAPGEF3O95398 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
RAPGEF3O95398 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
RAPGEF3O95398 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
RAPGEF3O95398 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
RAPGEF3O95398 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
RAPGEF3O95398 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
RAPGEF3O95398 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC36.09■■■■□ 3.37
RAPGEF3O95398 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
RAPGEF3O95398 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
RAPGEF3O95398 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
RAPGEF3O95398 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
RAPGEF3O95398 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
RAPGEF3O95398 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
RAPGEF3O95398 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
RAPGEF3O95398 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
RAPGEF3O95398 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
RAPGEF3O95398 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
RAPGEF3O95398 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
RAPGEF3O95398 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
RAPGEF3O95398 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
RAPGEF3O95398 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
RAPGEF3O95398 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
RAPGEF3O95398 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
RAPGEF3O95398 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC36.04■■■■□ 3.36
RAPGEF3O95398 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
RAPGEF3O95398 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC36.04■■■■□ 3.36
RAPGEF3O95398 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
RAPGEF3O95398 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
RAPGEF3O95398 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
RAPGEF3O95398 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
RAPGEF3O95398 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
RAPGEF3O95398 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
RAPGEF3O95398 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
RAPGEF3O95398 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
RAPGEF3O95398 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
RAPGEF3O95398 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
RAPGEF3O95398 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC36.01■■■■□ 3.36
RAPGEF3O95398 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
RAPGEF3O95398 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
RAPGEF3O95398 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
RAPGEF3O95398 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
RAPGEF3O95398 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
RAPGEF3O95398 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
RAPGEF3O95398 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
RAPGEF3O95398 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
RAPGEF3O95398 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
RAPGEF3O95398 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
RAPGEF3O95398 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms