Protein–RNA interactions for Protein: O95219

SNX4, Sorting nexin-4, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX4O95219 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX4O95219 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX4O95219 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX4O95219 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX4O95219 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX4O95219 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX4O95219 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX4O95219 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX4O95219 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX4O95219 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX4O95219 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX4O95219 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX4O95219 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX4O95219 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX4O95219 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX4O95219 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX4O95219 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX4O95219 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX4O95219 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX4O95219 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX4O95219 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX4O95219 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX4O95219 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX4O95219 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX4O95219 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX4O95219 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX4O95219 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX4O95219 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX4O95219 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX4O95219 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX4O95219 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX4O95219 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX4O95219 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX4O95219 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX4O95219 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX4O95219 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX4O95219 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX4O95219 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX4O95219 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX4O95219 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX4O95219 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX4O95219 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX4O95219 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX4O95219 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX4O95219 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX4O95219 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX4O95219 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX4O95219 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX4O95219 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX4O95219 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX4O95219 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX4O95219 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX4O95219 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX4O95219 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX4O95219 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX4O95219 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX4O95219 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX4O95219 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX4O95219 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX4O95219 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX4O95219 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX4O95219 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX4O95219 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX4O95219 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX4O95219 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX4O95219 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX4O95219 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX4O95219 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX4O95219 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX4O95219 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX4O95219 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX4O95219 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SNX4O95219 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SNX4O95219 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX4O95219 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX4O95219 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX4O95219 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX4O95219 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX4O95219 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX4O95219 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX4O95219 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX4O95219 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX4O95219 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX4O95219 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX4O95219 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX4O95219 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX4O95219 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX4O95219 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX4O95219 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX4O95219 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX4O95219 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX4O95219 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX4O95219 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX4O95219 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX4O95219 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX4O95219 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX4O95219 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX4O95219 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX4O95219 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX4O95219 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms