Protein–RNA interactions for Protein: O94876

TMCC1, Transmembrane and coiled-coil domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCC1O94876 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMCC1O94876 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMCC1O94876 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMCC1O94876 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMCC1O94876 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMCC1O94876 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMCC1O94876 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMCC1O94876 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMCC1O94876 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMCC1O94876 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMCC1O94876 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TMCC1O94876 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMCC1O94876 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMCC1O94876 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMCC1O94876 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMCC1O94876 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMCC1O94876 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMCC1O94876 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TMCC1O94876 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMCC1O94876 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMCC1O94876 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMCC1O94876 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMCC1O94876 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMCC1O94876 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMCC1O94876 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMCC1O94876 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMCC1O94876 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMCC1O94876 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMCC1O94876 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMCC1O94876 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMCC1O94876 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMCC1O94876 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMCC1O94876 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMCC1O94876 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMCC1O94876 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMCC1O94876 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMCC1O94876 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMCC1O94876 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMCC1O94876 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMCC1O94876 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMCC1O94876 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMCC1O94876 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TMCC1O94876 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMCC1O94876 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMCC1O94876 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMCC1O94876 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMCC1O94876 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMCC1O94876 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMCC1O94876 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMCC1O94876 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMCC1O94876 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMCC1O94876 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMCC1O94876 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMCC1O94876 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMCC1O94876 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMCC1O94876 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMCC1O94876 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMCC1O94876 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMCC1O94876 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMCC1O94876 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMCC1O94876 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMCC1O94876 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMCC1O94876 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TMCC1O94876 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMCC1O94876 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMCC1O94876 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMCC1O94876 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMCC1O94876 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMCC1O94876 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMCC1O94876 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMCC1O94876 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMCC1O94876 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMCC1O94876 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMCC1O94876 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMCC1O94876 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TMCC1O94876 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMCC1O94876 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMCC1O94876 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMCC1O94876 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMCC1O94876 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMCC1O94876 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMCC1O94876 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMCC1O94876 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMCC1O94876 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMCC1O94876 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMCC1O94876 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMCC1O94876 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TMCC1O94876 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMCC1O94876 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMCC1O94876 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMCC1O94876 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMCC1O94876 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TMCC1O94876 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMCC1O94876 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMCC1O94876 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMCC1O94876 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMCC1O94876 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMCC1O94876 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMCC1O94876 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMCC1O94876 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms