Protein–RNA interactions for Protein: O94769

ECM2, Extracellular matrix protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM2O94769 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ECM2O94769 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ECM2O94769 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ECM2O94769 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ECM2O94769 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ECM2O94769 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ECM2O94769 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ECM2O94769 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ECM2O94769 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ECM2O94769 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ECM2O94769 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ECM2O94769 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ECM2O94769 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ECM2O94769 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ECM2O94769 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ECM2O94769 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ECM2O94769 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ECM2O94769 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ECM2O94769 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ECM2O94769 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ECM2O94769 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ECM2O94769 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ECM2O94769 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ECM2O94769 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ECM2O94769 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ECM2O94769 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ECM2O94769 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ECM2O94769 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ECM2O94769 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ECM2O94769 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ECM2O94769 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ECM2O94769 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ECM2O94769 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ECM2O94769 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ECM2O94769 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ECM2O94769 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ECM2O94769 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ECM2O94769 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
ECM2O94769 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ECM2O94769 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
ECM2O94769 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ECM2O94769 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ECM2O94769 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
ECM2O94769 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ECM2O94769 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ECM2O94769 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
ECM2O94769 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ECM2O94769 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ECM2O94769 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ECM2O94769 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
ECM2O94769 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ECM2O94769 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ECM2O94769 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
ECM2O94769 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
ECM2O94769 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ECM2O94769 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ECM2O94769 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ECM2O94769 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ECM2O94769 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ECM2O94769 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ECM2O94769 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ECM2O94769 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ECM2O94769 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ECM2O94769 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ECM2O94769 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ECM2O94769 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ECM2O94769 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ECM2O94769 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ECM2O94769 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
ECM2O94769 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
ECM2O94769 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ECM2O94769 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ECM2O94769 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ECM2O94769 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ECM2O94769 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
ECM2O94769 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ECM2O94769 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ECM2O94769 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ECM2O94769 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
ECM2O94769 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ECM2O94769 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ECM2O94769 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ECM2O94769 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ECM2O94769 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ECM2O94769 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ECM2O94769 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ECM2O94769 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
ECM2O94769 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ECM2O94769 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ECM2O94769 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ECM2O94769 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ECM2O94769 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ECM2O94769 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ECM2O94769 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ECM2O94769 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ECM2O94769 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ECM2O94769 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ECM2O94769 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ECM2O94769 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ECM2O94769 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.5 ms