Protein–RNA interactions for Protein: O75751

SLC22A3, Solute carrier family 22 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A3O75751 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC22A3O75751 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC22A3O75751 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC22A3O75751 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC22A3O75751 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC22A3O75751 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC22A3O75751 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC22A3O75751 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC22A3O75751 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC22A3O75751 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC22A3O75751 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC22A3O75751 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC22A3O75751 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC22A3O75751 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC22A3O75751 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC22A3O75751 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC22A3O75751 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC22A3O75751 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC22A3O75751 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC22A3O75751 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC22A3O75751 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC22A3O75751 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC22A3O75751 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC22A3O75751 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC22A3O75751 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC22A3O75751 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC22A3O75751 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC22A3O75751 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC22A3O75751 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC22A3O75751 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC22A3O75751 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC22A3O75751 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC22A3O75751 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC22A3O75751 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC22A3O75751 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC22A3O75751 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC22A3O75751 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC22A3O75751 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC22A3O75751 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC22A3O75751 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC22A3O75751 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC22A3O75751 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC22A3O75751 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC22A3O75751 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC22A3O75751 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC22A3O75751 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC22A3O75751 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC22A3O75751 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC22A3O75751 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC22A3O75751 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC22A3O75751 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC22A3O75751 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC22A3O75751 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC22A3O75751 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC22A3O75751 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC22A3O75751 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC22A3O75751 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC22A3O75751 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC22A3O75751 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC22A3O75751 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC22A3O75751 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC22A3O75751 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC22A3O75751 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC22A3O75751 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC22A3O75751 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC22A3O75751 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC22A3O75751 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC22A3O75751 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SLC22A3O75751 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SLC22A3O75751 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC22A3O75751 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC22A3O75751 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC22A3O75751 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC22A3O75751 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC22A3O75751 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC22A3O75751 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC22A3O75751 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC22A3O75751 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC22A3O75751 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC22A3O75751 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC22A3O75751 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC22A3O75751 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC22A3O75751 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC22A3O75751 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC22A3O75751 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC22A3O75751 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC22A3O75751 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC22A3O75751 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC22A3O75751 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC22A3O75751 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC22A3O75751 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC22A3O75751 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC22A3O75751 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC22A3O75751 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC22A3O75751 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC22A3O75751 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC22A3O75751 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC22A3O75751 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC22A3O75751 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC22A3O75751 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms