Protein–RNA interactions for Protein: O75364

PITX3, Pituitary homeobox 3, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3O75364 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PITX3O75364 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PITX3O75364 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PITX3O75364 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PITX3O75364 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PITX3O75364 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PITX3O75364 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PITX3O75364 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PITX3O75364 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PITX3O75364 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PITX3O75364 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PITX3O75364 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PITX3O75364 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PITX3O75364 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PITX3O75364 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PITX3O75364 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PITX3O75364 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PITX3O75364 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PITX3O75364 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PITX3O75364 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PITX3O75364 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PITX3O75364 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PITX3O75364 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PITX3O75364 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PITX3O75364 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PITX3O75364 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PITX3O75364 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PITX3O75364 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PITX3O75364 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PITX3O75364 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PITX3O75364 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PITX3O75364 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PITX3O75364 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PITX3O75364 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PITX3O75364 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PITX3O75364 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PITX3O75364 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PITX3O75364 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PITX3O75364 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PITX3O75364 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PITX3O75364 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PITX3O75364 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PITX3O75364 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PITX3O75364 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PITX3O75364 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PITX3O75364 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PITX3O75364 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PITX3O75364 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PITX3O75364 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PITX3O75364 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PITX3O75364 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PITX3O75364 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PITX3O75364 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PITX3O75364 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PITX3O75364 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PITX3O75364 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PITX3O75364 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PITX3O75364 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PITX3O75364 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PITX3O75364 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PITX3O75364 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PITX3O75364 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PITX3O75364 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PITX3O75364 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PITX3O75364 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PITX3O75364 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PITX3O75364 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PITX3O75364 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PITX3O75364 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PITX3O75364 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PITX3O75364 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PITX3O75364 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PITX3O75364 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PITX3O75364 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PITX3O75364 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PITX3O75364 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PITX3O75364 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PITX3O75364 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PITX3O75364 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PITX3O75364 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PITX3O75364 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PITX3O75364 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PITX3O75364 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PITX3O75364 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PITX3O75364 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PITX3O75364 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PITX3O75364 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PITX3O75364 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PITX3O75364 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PITX3O75364 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PITX3O75364 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PITX3O75364 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PITX3O75364 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PITX3O75364 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PITX3O75364 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PITX3O75364 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PITX3O75364 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PITX3O75364 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PITX3O75364 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PITX3O75364 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms