Protein–RNA interactions for Protein: O75334

PPFIA2, Liprin-alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA2O75334 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPFIA2O75334 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPFIA2O75334 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPFIA2O75334 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPFIA2O75334 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPFIA2O75334 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPFIA2O75334 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPFIA2O75334 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PPFIA2O75334 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPFIA2O75334 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPFIA2O75334 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPFIA2O75334 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPFIA2O75334 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPFIA2O75334 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPFIA2O75334 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPFIA2O75334 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPFIA2O75334 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPFIA2O75334 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PPFIA2O75334 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPFIA2O75334 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPFIA2O75334 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPFIA2O75334 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPFIA2O75334 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPFIA2O75334 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPFIA2O75334 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPFIA2O75334 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPFIA2O75334 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPFIA2O75334 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPFIA2O75334 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PPFIA2O75334 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPFIA2O75334 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPFIA2O75334 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPFIA2O75334 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPFIA2O75334 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPFIA2O75334 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPFIA2O75334 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPFIA2O75334 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPFIA2O75334 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPFIA2O75334 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PPFIA2O75334 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PPFIA2O75334 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PPFIA2O75334 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPFIA2O75334 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPFIA2O75334 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPFIA2O75334 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPFIA2O75334 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PPFIA2O75334 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPFIA2O75334 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPFIA2O75334 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPFIA2O75334 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPFIA2O75334 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPFIA2O75334 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PPFIA2O75334 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPFIA2O75334 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPFIA2O75334 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPFIA2O75334 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPFIA2O75334 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPFIA2O75334 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPFIA2O75334 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PPFIA2O75334 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPFIA2O75334 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPFIA2O75334 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPFIA2O75334 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPFIA2O75334 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPFIA2O75334 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPFIA2O75334 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPFIA2O75334 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPFIA2O75334 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPFIA2O75334 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPFIA2O75334 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPFIA2O75334 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPFIA2O75334 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPFIA2O75334 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPFIA2O75334 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPFIA2O75334 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPFIA2O75334 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPFIA2O75334 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPFIA2O75334 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPFIA2O75334 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPFIA2O75334 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPFIA2O75334 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPFIA2O75334 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPFIA2O75334 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPFIA2O75334 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPFIA2O75334 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPFIA2O75334 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPFIA2O75334 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPFIA2O75334 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPFIA2O75334 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPFIA2O75334 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PPFIA2O75334 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPFIA2O75334 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPFIA2O75334 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPFIA2O75334 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPFIA2O75334 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPFIA2O75334 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPFIA2O75334 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PPFIA2O75334 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PPFIA2O75334 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PPFIA2O75334 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms