Protein–RNA interactions for Protein: O75143

ATG13, Autophagy-related protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13O75143 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATG13O75143 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATG13O75143 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATG13O75143 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ATG13O75143 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATG13O75143 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATG13O75143 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATG13O75143 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATG13O75143 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ATG13O75143 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATG13O75143 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATG13O75143 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ATG13O75143 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ATG13O75143 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ATG13O75143 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ATG13O75143 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ATG13O75143 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATG13O75143 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATG13O75143 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATG13O75143 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATG13O75143 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATG13O75143 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATG13O75143 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ATG13O75143 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ATG13O75143 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ATG13O75143 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATG13O75143 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATG13O75143 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATG13O75143 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATG13O75143 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATG13O75143 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATG13O75143 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATG13O75143 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATG13O75143 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATG13O75143 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATG13O75143 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATG13O75143 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATG13O75143 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATG13O75143 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATG13O75143 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATG13O75143 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATG13O75143 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATG13O75143 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATG13O75143 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATG13O75143 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATG13O75143 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATG13O75143 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATG13O75143 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATG13O75143 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATG13O75143 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATG13O75143 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATG13O75143 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATG13O75143 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATG13O75143 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATG13O75143 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATG13O75143 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATG13O75143 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATG13O75143 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ATG13O75143 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ATG13O75143 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATG13O75143 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATG13O75143 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATG13O75143 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATG13O75143 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATG13O75143 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATG13O75143 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATG13O75143 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATG13O75143 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATG13O75143 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATG13O75143 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATG13O75143 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATG13O75143 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATG13O75143 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATG13O75143 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATG13O75143 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATG13O75143 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATG13O75143 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATG13O75143 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATG13O75143 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATG13O75143 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATG13O75143 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATG13O75143 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATG13O75143 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATG13O75143 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATG13O75143 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATG13O75143 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ATG13O75143 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATG13O75143 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATG13O75143 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATG13O75143 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATG13O75143 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATG13O75143 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATG13O75143 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATG13O75143 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATG13O75143 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATG13O75143 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATG13O75143 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATG13O75143 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATG13O75143 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATG13O75143 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms