Protein–RNA interactions for Protein: O60488

ACSL4, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 4, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL4O60488 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACSL4O60488 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACSL4O60488 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACSL4O60488 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACSL4O60488 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ACSL4O60488 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACSL4O60488 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACSL4O60488 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ACSL4O60488 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACSL4O60488 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACSL4O60488 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACSL4O60488 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACSL4O60488 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACSL4O60488 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACSL4O60488 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACSL4O60488 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACSL4O60488 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ACSL4O60488 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ACSL4O60488 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ACSL4O60488 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ACSL4O60488 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ACSL4O60488 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACSL4O60488 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACSL4O60488 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACSL4O60488 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACSL4O60488 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACSL4O60488 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACSL4O60488 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACSL4O60488 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACSL4O60488 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACSL4O60488 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACSL4O60488 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACSL4O60488 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACSL4O60488 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACSL4O60488 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ACSL4O60488 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACSL4O60488 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACSL4O60488 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACSL4O60488 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACSL4O60488 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACSL4O60488 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACSL4O60488 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACSL4O60488 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACSL4O60488 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACSL4O60488 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACSL4O60488 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACSL4O60488 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACSL4O60488 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACSL4O60488 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACSL4O60488 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACSL4O60488 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACSL4O60488 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACSL4O60488 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ACSL4O60488 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACSL4O60488 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACSL4O60488 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACSL4O60488 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACSL4O60488 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACSL4O60488 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ACSL4O60488 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ACSL4O60488 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACSL4O60488 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACSL4O60488 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACSL4O60488 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACSL4O60488 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACSL4O60488 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACSL4O60488 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACSL4O60488 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACSL4O60488 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACSL4O60488 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACSL4O60488 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACSL4O60488 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACSL4O60488 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACSL4O60488 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACSL4O60488 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACSL4O60488 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ACSL4O60488 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACSL4O60488 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACSL4O60488 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACSL4O60488 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACSL4O60488 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACSL4O60488 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACSL4O60488 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACSL4O60488 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACSL4O60488 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACSL4O60488 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ACSL4O60488 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACSL4O60488 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACSL4O60488 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACSL4O60488 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ACSL4O60488 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACSL4O60488 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACSL4O60488 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACSL4O60488 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACSL4O60488 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ACSL4O60488 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACSL4O60488 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACSL4O60488 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ACSL4O60488 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACSL4O60488 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms