Protein–RNA interactions for Protein: O43805

SSNA1, Sjoegren syndrome nuclear autoantigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSNA1O43805 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SSNA1O43805 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SSNA1O43805 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SSNA1O43805 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SSNA1O43805 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SSNA1O43805 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SSNA1O43805 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SSNA1O43805 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SSNA1O43805 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SSNA1O43805 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SSNA1O43805 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SSNA1O43805 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SSNA1O43805 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SSNA1O43805 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SSNA1O43805 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SSNA1O43805 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SSNA1O43805 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SSNA1O43805 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SSNA1O43805 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SSNA1O43805 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SSNA1O43805 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SSNA1O43805 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SSNA1O43805 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SSNA1O43805 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SSNA1O43805 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SSNA1O43805 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SSNA1O43805 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SSNA1O43805 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SSNA1O43805 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SSNA1O43805 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SSNA1O43805 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SSNA1O43805 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SSNA1O43805 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SSNA1O43805 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SSNA1O43805 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SSNA1O43805 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SSNA1O43805 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SSNA1O43805 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SSNA1O43805 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SSNA1O43805 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SSNA1O43805 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SSNA1O43805 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SSNA1O43805 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SSNA1O43805 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SSNA1O43805 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SSNA1O43805 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SSNA1O43805 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SSNA1O43805 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SSNA1O43805 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SSNA1O43805 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SSNA1O43805 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SSNA1O43805 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SSNA1O43805 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SSNA1O43805 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SSNA1O43805 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SSNA1O43805 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SSNA1O43805 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SSNA1O43805 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SSNA1O43805 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SSNA1O43805 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SSNA1O43805 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SSNA1O43805 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SSNA1O43805 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SSNA1O43805 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SSNA1O43805 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SSNA1O43805 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SSNA1O43805 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SSNA1O43805 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SSNA1O43805 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SSNA1O43805 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SSNA1O43805 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SSNA1O43805 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SSNA1O43805 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SSNA1O43805 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SSNA1O43805 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SSNA1O43805 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SSNA1O43805 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SSNA1O43805 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SSNA1O43805 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SSNA1O43805 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SSNA1O43805 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SSNA1O43805 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SSNA1O43805 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SSNA1O43805 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SSNA1O43805 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SSNA1O43805 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SSNA1O43805 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SSNA1O43805 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SSNA1O43805 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SSNA1O43805 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SSNA1O43805 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SSNA1O43805 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SSNA1O43805 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SSNA1O43805 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SSNA1O43805 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SSNA1O43805 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SSNA1O43805 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SSNA1O43805 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SSNA1O43805 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SSNA1O43805 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 465 ms