Protein–RNA interactions for Protein: O43791

SPOP, Speckle-type POZ protein, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOPO43791 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPOPO43791 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPOPO43791 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPOPO43791 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPOPO43791 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPOPO43791 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPOPO43791 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPOPO43791 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPOPO43791 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPOPO43791 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPOPO43791 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPOPO43791 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPOPO43791 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPOPO43791 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPOPO43791 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPOPO43791 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPOPO43791 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPOPO43791 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPOPO43791 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SPOPO43791 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPOPO43791 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPOPO43791 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPOPO43791 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPOPO43791 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPOPO43791 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPOPO43791 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPOPO43791 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPOPO43791 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPOPO43791 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPOPO43791 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPOPO43791 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPOPO43791 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPOPO43791 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPOPO43791 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SPOPO43791 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SPOPO43791 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPOPO43791 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPOPO43791 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPOPO43791 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPOPO43791 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPOPO43791 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPOPO43791 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPOPO43791 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPOPO43791 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPOPO43791 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPOPO43791 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPOPO43791 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPOPO43791 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPOPO43791 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPOPO43791 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPOPO43791 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPOPO43791 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPOPO43791 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPOPO43791 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPOPO43791 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPOPO43791 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPOPO43791 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPOPO43791 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPOPO43791 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPOPO43791 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPOPO43791 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPOPO43791 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPOPO43791 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPOPO43791 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPOPO43791 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPOPO43791 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPOPO43791 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SPOPO43791 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPOPO43791 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPOPO43791 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPOPO43791 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPOPO43791 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPOPO43791 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPOPO43791 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPOPO43791 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPOPO43791 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPOPO43791 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPOPO43791 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPOPO43791 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SPOPO43791 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPOPO43791 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPOPO43791 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPOPO43791 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPOPO43791 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPOPO43791 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SPOPO43791 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SPOPO43791 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPOPO43791 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPOPO43791 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPOPO43791 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SPOPO43791 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SPOPO43791 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPOPO43791 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPOPO43791 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPOPO43791 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPOPO43791 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPOPO43791 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPOPO43791 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPOPO43791 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPOPO43791 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms