Protein–RNA interactions for Protein: O43251

RBFOX2, RNA binding protein fox-1 homolog 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBFOX2O43251 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.574e-10■■■■■ 36.4
RBFOX2O43251 ARHGEF12-208ENST00000529970 3786 ntTSL 23.27□□□□□ -1.894e-10■■■■■ 36.4
RBFOX2O43251 ARHGEF12-209ENST00000530388 4309 ntTSL 1 (best)3.16□□□□□ -1.94e-10■■■■■ 36.4
RBFOX2O43251 TCEA2-213ENST00000475792 655 ntTSL 213.08□□□□□ -0.322e-7■■■■■ 36.4
RBFOX2O43251 DVL1-208ENST00000634054 828 ntTSL 516.1■□□□□ 0.177e-9■■■■■ 36.3
RBFOX2O43251 MXI1-209ENST00000484030 838 ntTSL 55.67□□□□□ -1.51e-8■■■■■ 36.3
RBFOX2O43251 SH3TC1-220ENST00000511002 1124 ntTSL 512.27□□□□□ -0.452e-19■■■■■ 36.3
RBFOX2O43251 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.546e-8■■■■■ 36.2
RBFOX2O43251 DAGLB-205ENST00000454738 1374 ntTSL 218.17■□□□□ 0.55e-8■■■■■ 36.1
RBFOX2O43251 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.125e-8■■■■■ 36.1
RBFOX2O43251 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.515e-8■■■■■ 36.1
RBFOX2O43251 DAGLB-206ENST00000462934 2589 ntTSL 211.19□□□□□ -0.625e-8■■■■■ 36.1
RBFOX2O43251 RHBDL1-203ENST00000450775 1566 ntTSL 220.12■□□□□ 0.819e-12■■■■■ 36.1
RBFOX2O43251 RHBDL1-204ENST00000561556 796 ntTSL 317.14■□□□□ 0.339e-12■■■■■ 36.1
RBFOX2O43251 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.089e-12■■■■■ 36.1
RBFOX2O43251 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.059e-12■■■■■ 36.1
RBFOX2O43251 SLC26A6-214ENST00000462009 825 ntTSL 315.44■□□□□ 0.061e-18■■■■■ 36.1
RBFOX2O43251 ZER1-201ENST00000291900 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.852e-10■■■■■ 36
RBFOX2O43251 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.363e-10■■■■■ 36
RBFOX2O43251 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.523e-10■■■■■ 36
RBFOX2O43251 MTMR4-204ENST00000579925 5622 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.633e-10■■■■■ 36
RBFOX2O43251 NIPAL3-201ENST00000003912 5481 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.033e-10■■■■■ 36
RBFOX2O43251 MTMR4-201ENST00000323456 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.033e-10■■■■■ 36
RBFOX2O43251 WDFY2-201ENST00000298125 9321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.13e-10■■■■■ 36
RBFOX2O43251 ERBIN-205ENST00000416865 2351 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.453e-10■■■■■ 36
RBFOX2O43251 ERBIN-216ENST00000512354 474 ntTSL 45.09□□□□□ -1.593e-10■■■■■ 36
RBFOX2O43251 ERBIN-206ENST00000503913 544 ntTSL 34.98□□□□□ -1.613e-10■■■■■ 36
RBFOX2O43251 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.623e-10■■■■■ 36
RBFOX2O43251 NIPAL3-205ENST00000432012 2714 ntTSL 1 (best)4.89□□□□□ -1.633e-10■■■■■ 36
RBFOX2O43251 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.853e-10■■■■■ 36
RBFOX2O43251 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.873e-10■■■■■ 36
RBFOX2O43251 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.943e-10■■■■■ 36
RBFOX2O43251 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.953e-10■■■■■ 36
RBFOX2O43251 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -23e-10■■■■■ 36
RBFOX2O43251 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.13e-10■■■■■ 36
RBFOX2O43251 ERBIN-215ENST00000511671 589 ntTSL 30.9□□□□□ -2.273e-10■■■■■ 36
RBFOX2O43251 AP1G2-223ENST00000556277 891 ntTSL 513.1□□□□□ -0.313e-12■■■■■ 36
RBFOX2O43251 AP1G2-231ENST00000557189 678 ntTSL 212.36□□□□□ -0.433e-12■■■■■ 36
RBFOX2O43251 AP1G2-225ENST00000556743 1456 ntTSL 1 (best)11.44□□□□□ -0.583e-12■■■■■ 36
RBFOX2O43251 AP1G2-226ENST00000556843 562 ntTSL 410.87□□□□□ -0.673e-12■■■■■ 36
RBFOX2O43251 AP1G2-207ENST00000553685 561 ntTSL 1 (best)10.8□□□□□ -0.683e-12■■■■■ 36
RBFOX2O43251 AP1G2-208ENST00000553756 656 ntTSL 310.68□□□□□ -0.73e-12■■■■■ 36
RBFOX2O43251 AP1G2-206ENST00000553629 1301 ntTSL 1 (best)10.15□□□□□ -0.783e-12■■■■■ 36
RBFOX2O43251 AP1G2-234ENST00000557619 1004 ntTSL 210.1□□□□□ -0.793e-12■■■■■ 36
RBFOX2O43251 AP1G2-227ENST00000556943 747 ntTSL 38.14□□□□□ -1.113e-12■■■■■ 36
RBFOX2O43251 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.574e-7■■■■■ 35.9
RBFOX2O43251 PFKL-209ENST00000495274 951 ntTSL 212.99□□□□□ -0.337e-18■■■■■ 35.9
RBFOX2O43251 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.122e-6■■■■■ 35.9
RBFOX2O43251 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.032e-6■■■■■ 35.9
RBFOX2O43251 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.152e-6■■■■■ 35.9
RBFOX2O43251 CSF1-206ENST00000488198 1009 ntTSL 313.93□□□□□ -0.182e-6■■■■■ 35.9
RBFOX2O43251 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.52e-6■■■■■ 35.9
RBFOX2O43251 SNRNP70-207ENST00000598984 547 ntTSL 514.49□□□□□ -0.092e-10■■■■■ 35.8
RBFOX2O43251 SNRNP70-208ENST00000599687 563 ntTSL 26.63□□□□□ -1.352e-10■■■■■ 35.8
RBFOX2O43251 TFPI-207ENST00000421427 804 ntTSL 37.7□□□□□ -1.182e-17■■■■■ 35.8
RBFOX2O43251 TFPI-206ENST00000420747 685 ntTSL 36.5□□□□□ -1.372e-17■■■■■ 35.8
RBFOX2O43251 TFPI-209ENST00000437725 545 ntTSL 44.42□□□□□ -1.72e-17■■■■■ 35.8
RBFOX2O43251 TFPI-204ENST00000409676 1119 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.722e-17■■■■■ 35.8
RBFOX2O43251 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.912e-17■■■■■ 35.8
RBFOX2O43251 TFPI-202ENST00000339091 1088 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.982e-17■■■■■ 35.8
RBFOX2O43251 TFPI-210ENST00000453013 733 ntTSL 22.67□□□□□ -1.982e-17■■■■■ 35.8
RBFOX2O43251 TFPI-205ENST00000417013 554 ntTSL 22.13□□□□□ -2.072e-17■■■■■ 35.8
RBFOX2O43251 SYNJ2-206ENST00000485863 810 ntTSL 313.79□□□□□ -0.22e-8■■■■■ 35.8
RBFOX2O43251 SYNJ2-207ENST00000638626 7332 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.012e-8■■■■■ 35.8
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RBFOX2O43251 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.482e-6■■■■■ 35.8
RBFOX2O43251 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.495e-8■■■■■ 35.8
RBFOX2O43251 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.275e-8■■■■■ 35.8
RBFOX2O43251 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.265e-8■■■■■ 35.8
RBFOX2O43251 BRSK2-209ENST00000529433 3211 ntTSL 1 (best)16.41■□□□□ 0.225e-8■■■■■ 35.8
RBFOX2O43251 BRSK2-210ENST00000529951 1934 ntTSL 512.95□□□□□ -0.345e-8■■■■■ 35.8
RBFOX2O43251 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.345e-8■■■■■ 35.8
RBFOX2O43251 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.545e-8■■■■■ 35.8
RBFOX2O43251 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.575e-8■■■■■ 35.8
RBFOX2O43251 GPAM-203ENST00000480130 514 ntTSL 25.13□□□□□ -1.592e-7■■■■■ 35.7
RBFOX2O43251 GPAM-204ENST00000498541 351 ntTSL 33.55□□□□□ -1.842e-7■■■■■ 35.7
RBFOX2O43251 WDR90-203ENST00000420061 2342 ntTSL 1 (best)15.68■□□□□ 0.16e-7■■■■■ 35.7
RBFOX2O43251 WDR90-216ENST00000549648 2345 ntTSL 1 (best)15.49■□□□□ 0.076e-7■■■■■ 35.7
RBFOX2O43251 HERPUD1-219ENST00000570273 1425 ntTSL 1 (best)12.45□□□□□ -0.424e-14■■■■■ 35.7
RBFOX2O43251 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.196e-7■■■■■ 35.7
RBFOX2O43251 FOXN3-202ENST00000345097 7832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.196e-7■■■■■ 35.7
RBFOX2O43251 TTC7A-207ENST00000461601 2204 ntTSL 219.64■□□□□ 0.732e-7■■■■■ 35.7
RBFOX2O43251 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.372e-7■■■■■ 35.7
RBFOX2O43251 TTC7A-206ENST00000441914 2418 ntTSL 1 (best)14.41□□□□□ -0.12e-7■■■■■ 35.7
RBFOX2O43251 TTC7A-204ENST00000409825 4739 ntTSL 1 (best)12.51□□□□□ -0.412e-7■■■■■ 35.7
RBFOX2O43251 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.452e-7■■■■■ 35.7
RBFOX2O43251 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.492e-7■■■■■ 35.7
RBFOX2O43251 POLE-201ENST00000320574 7840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.721e-9■■■■■ 35.6
RBFOX2O43251 POLE-207ENST00000535270 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.761e-9■■■■■ 35.6
RBFOX2O43251 POLE-210ENST00000537064 8011 ntTSL 1 (best)9.07□□□□□ -0.961e-9■■■■■ 35.6
RBFOX2O43251 NOP53-202ENST00000594182 303 ntTSL 310.96□□□□□ -0.659e-23■■■■■ 35.6
RBFOX2O43251 NOP53-208ENST00000598959 501 ntTSL 57.67□□□□□ -1.189e-23■■■■■ 35.6
RBFOX2O43251 CRAMP1-206ENST00000468839 451 ntTSL 312.28□□□□□ -0.446e-7■■■■■ 35.6
RBFOX2O43251 RAB11FIP3-205ENST00000450428 3203 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.772e-11■■■■■ 35.6
RBFOX2O43251 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.94e-10■■■■■ 35.5
RBFOX2O43251 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.084e-10■■■■■ 35.5
RBFOX2O43251 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -04e-10■■■■■ 35.5
RBFOX2O43251 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.064e-10■■■■■ 35.5
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