Protein–RNA interactions for Protein: O43175

PHGDH, D-3-phosphoglycerate dehydrogenase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHGDHO43175 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHGDHO43175 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHGDHO43175 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHGDHO43175 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHGDHO43175 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHGDHO43175 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHGDHO43175 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHGDHO43175 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PHGDHO43175 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHGDHO43175 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHGDHO43175 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHGDHO43175 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHGDHO43175 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHGDHO43175 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHGDHO43175 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHGDHO43175 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHGDHO43175 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHGDHO43175 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHGDHO43175 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHGDHO43175 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHGDHO43175 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHGDHO43175 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHGDHO43175 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHGDHO43175 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHGDHO43175 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHGDHO43175 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHGDHO43175 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHGDHO43175 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHGDHO43175 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHGDHO43175 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHGDHO43175 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHGDHO43175 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHGDHO43175 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHGDHO43175 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHGDHO43175 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHGDHO43175 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHGDHO43175 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHGDHO43175 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHGDHO43175 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHGDHO43175 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PHGDHO43175 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHGDHO43175 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHGDHO43175 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PHGDHO43175 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PHGDHO43175 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHGDHO43175 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHGDHO43175 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHGDHO43175 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHGDHO43175 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHGDHO43175 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHGDHO43175 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PHGDHO43175 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHGDHO43175 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHGDHO43175 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHGDHO43175 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHGDHO43175 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHGDHO43175 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHGDHO43175 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHGDHO43175 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHGDHO43175 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHGDHO43175 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHGDHO43175 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHGDHO43175 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHGDHO43175 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHGDHO43175 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHGDHO43175 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PHGDHO43175 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHGDHO43175 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHGDHO43175 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHGDHO43175 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHGDHO43175 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHGDHO43175 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHGDHO43175 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHGDHO43175 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PHGDHO43175 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PHGDHO43175 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PHGDHO43175 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PHGDHO43175 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PHGDHO43175 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PHGDHO43175 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PHGDHO43175 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PHGDHO43175 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PHGDHO43175 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHGDHO43175 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHGDHO43175 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHGDHO43175 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHGDHO43175 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHGDHO43175 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHGDHO43175 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHGDHO43175 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHGDHO43175 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHGDHO43175 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHGDHO43175 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHGDHO43175 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHGDHO43175 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHGDHO43175 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHGDHO43175 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHGDHO43175 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHGDHO43175 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHGDHO43175 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms