Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
FANCAO15360 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
FANCAO15360 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC36.43■■■■□ 3.42
FANCAO15360 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
FANCAO15360 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
FANCAO15360 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
FANCAO15360 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
FANCAO15360 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
FANCAO15360 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
FANCAO15360 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
FANCAO15360 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
FANCAO15360 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
FANCAO15360 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
FANCAO15360 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
FANCAO15360 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
FANCAO15360 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
FANCAO15360 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
FANCAO15360 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
FANCAO15360 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
FANCAO15360 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
FANCAO15360 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
FANCAO15360 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
FANCAO15360 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
FANCAO15360 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
FANCAO15360 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC36.37■■■■□ 3.41
FANCAO15360 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
FANCAO15360 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
FANCAO15360 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
FANCAO15360 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
FANCAO15360 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC36.36■■■■□ 3.41
FANCAO15360 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
FANCAO15360 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
FANCAO15360 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
FANCAO15360 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
FANCAO15360 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
FANCAO15360 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
FANCAO15360 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
FANCAO15360 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
FANCAO15360 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
FANCAO15360 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
FANCAO15360 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
FANCAO15360 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
FANCAO15360 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
FANCAO15360 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
FANCAO15360 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
FANCAO15360 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
FANCAO15360 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
FANCAO15360 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
FANCAO15360 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC36.3■■■■□ 3.4
FANCAO15360 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
FANCAO15360 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
FANCAO15360 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
FANCAO15360 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
FANCAO15360 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
FANCAO15360 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
FANCAO15360 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.28■■■■□ 3.4
FANCAO15360 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
FANCAO15360 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
FANCAO15360 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC36.28■■■■□ 3.4
FANCAO15360 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
FANCAO15360 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
FANCAO15360 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
FANCAO15360 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
FANCAO15360 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
FANCAO15360 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC36.26■■■■□ 3.4
FANCAO15360 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
FANCAO15360 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC36.26■■■■□ 3.4
FANCAO15360 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
FANCAO15360 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
FANCAO15360 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
FANCAO15360 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
FANCAO15360 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
FANCAO15360 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
FANCAO15360 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
FANCAO15360 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
FANCAO15360 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
FANCAO15360 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
FANCAO15360 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
FANCAO15360 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
FANCAO15360 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
FANCAO15360 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
FANCAO15360 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
FANCAO15360 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
FANCAO15360 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
FANCAO15360 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
FANCAO15360 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
FANCAO15360 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
FANCAO15360 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
FANCAO15360 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
FANCAO15360 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC36.2■■■■□ 3.39
FANCAO15360 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
FANCAO15360 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
FANCAO15360 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
FANCAO15360 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
FANCAO15360 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
FANCAO15360 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
FANCAO15360 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
FANCAO15360 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
FANCAO15360 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
FANCAO15360 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms