Protein–RNA interactions for Protein: O15047

SETD1A, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1AO15047 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
SETD1AO15047 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
SETD1AO15047 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC33.71■■■□□ 2.99
SETD1AO15047 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
SETD1AO15047 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
SETD1AO15047 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
SETD1AO15047 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC33.7■■■□□ 2.99
SETD1AO15047 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
SETD1AO15047 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
SETD1AO15047 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
SETD1AO15047 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
SETD1AO15047 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
SETD1AO15047 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
SETD1AO15047 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
SETD1AO15047 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
SETD1AO15047 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SETD1AO15047 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SETD1AO15047 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
SETD1AO15047 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
SETD1AO15047 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
SETD1AO15047 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
SETD1AO15047 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
SETD1AO15047 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
SETD1AO15047 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
SETD1AO15047 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
SETD1AO15047 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
SETD1AO15047 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
SETD1AO15047 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
SETD1AO15047 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
SETD1AO15047 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
SETD1AO15047 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
SETD1AO15047 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
SETD1AO15047 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
SETD1AO15047 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
SETD1AO15047 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
SETD1AO15047 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
SETD1AO15047 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
SETD1AO15047 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
SETD1AO15047 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
SETD1AO15047 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
SETD1AO15047 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
SETD1AO15047 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
SETD1AO15047 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
SETD1AO15047 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
SETD1AO15047 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
SETD1AO15047 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
SETD1AO15047 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
SETD1AO15047 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
SETD1AO15047 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
SETD1AO15047 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
SETD1AO15047 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
SETD1AO15047 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC33.61■■■□□ 2.97
SETD1AO15047 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
SETD1AO15047 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
SETD1AO15047 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
SETD1AO15047 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
SETD1AO15047 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
SETD1AO15047 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
SETD1AO15047 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
SETD1AO15047 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
SETD1AO15047 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
SETD1AO15047 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
SETD1AO15047 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
SETD1AO15047 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
SETD1AO15047 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC33.57■■■□□ 2.97
SETD1AO15047 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
SETD1AO15047 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
SETD1AO15047 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
SETD1AO15047 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
SETD1AO15047 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
SETD1AO15047 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
SETD1AO15047 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
SETD1AO15047 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
SETD1AO15047 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
SETD1AO15047 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
SETD1AO15047 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SETD1AO15047 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SETD1AO15047 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
SETD1AO15047 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
SETD1AO15047 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SETD1AO15047 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
SETD1AO15047 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
SETD1AO15047 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
SETD1AO15047 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
SETD1AO15047 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
SETD1AO15047 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
SETD1AO15047 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SETD1AO15047 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
SETD1AO15047 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SETD1AO15047 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SETD1AO15047 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
SETD1AO15047 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
SETD1AO15047 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
SETD1AO15047 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
SETD1AO15047 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
SETD1AO15047 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
SETD1AO15047 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
SETD1AO15047 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
SETD1AO15047 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
SETD1AO15047 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms