Protein–RNA interactions for Protein: O14493

CLDN4, Claudin-4, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN4O14493 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN4O14493 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN4O14493 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN4O14493 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN4O14493 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN4O14493 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN4O14493 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN4O14493 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN4O14493 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN4O14493 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN4O14493 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN4O14493 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN4O14493 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN4O14493 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN4O14493 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN4O14493 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN4O14493 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN4O14493 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN4O14493 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN4O14493 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN4O14493 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN4O14493 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN4O14493 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN4O14493 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN4O14493 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN4O14493 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN4O14493 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN4O14493 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN4O14493 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN4O14493 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN4O14493 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN4O14493 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN4O14493 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN4O14493 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN4O14493 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN4O14493 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN4O14493 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN4O14493 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN4O14493 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN4O14493 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN4O14493 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN4O14493 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN4O14493 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN4O14493 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN4O14493 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN4O14493 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN4O14493 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN4O14493 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN4O14493 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN4O14493 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN4O14493 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN4O14493 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN4O14493 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN4O14493 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN4O14493 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN4O14493 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN4O14493 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN4O14493 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN4O14493 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN4O14493 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN4O14493 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN4O14493 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN4O14493 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLDN4O14493 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLDN4O14493 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLDN4O14493 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLDN4O14493 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDN4O14493 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDN4O14493 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN4O14493 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN4O14493 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN4O14493 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN4O14493 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN4O14493 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN4O14493 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN4O14493 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN4O14493 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN4O14493 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN4O14493 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN4O14493 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN4O14493 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN4O14493 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN4O14493 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN4O14493 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN4O14493 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN4O14493 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN4O14493 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN4O14493 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN4O14493 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN4O14493 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN4O14493 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN4O14493 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN4O14493 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN4O14493 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN4O14493 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN4O14493 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN4O14493 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN4O14493 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN4O14493 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN4O14493 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms