Protein–RNA interactions for Protein: O00311

CDC7, Cell division cycle 7-related protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC7O00311 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDC7O00311 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDC7O00311 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDC7O00311 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDC7O00311 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDC7O00311 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDC7O00311 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDC7O00311 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDC7O00311 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDC7O00311 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CDC7O00311 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDC7O00311 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDC7O00311 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDC7O00311 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDC7O00311 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDC7O00311 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDC7O00311 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDC7O00311 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDC7O00311 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDC7O00311 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDC7O00311 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDC7O00311 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDC7O00311 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDC7O00311 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDC7O00311 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDC7O00311 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDC7O00311 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDC7O00311 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDC7O00311 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CDC7O00311 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDC7O00311 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDC7O00311 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDC7O00311 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDC7O00311 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDC7O00311 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CDC7O00311 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDC7O00311 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDC7O00311 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDC7O00311 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDC7O00311 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CDC7O00311 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDC7O00311 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDC7O00311 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDC7O00311 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDC7O00311 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDC7O00311 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDC7O00311 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDC7O00311 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDC7O00311 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDC7O00311 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDC7O00311 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDC7O00311 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDC7O00311 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDC7O00311 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDC7O00311 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDC7O00311 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDC7O00311 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDC7O00311 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDC7O00311 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CDC7O00311 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDC7O00311 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDC7O00311 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDC7O00311 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDC7O00311 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDC7O00311 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CDC7O00311 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CDC7O00311 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDC7O00311 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDC7O00311 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDC7O00311 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDC7O00311 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDC7O00311 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDC7O00311 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDC7O00311 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDC7O00311 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDC7O00311 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDC7O00311 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CDC7O00311 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDC7O00311 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDC7O00311 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDC7O00311 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDC7O00311 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDC7O00311 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDC7O00311 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDC7O00311 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDC7O00311 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDC7O00311 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDC7O00311 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDC7O00311 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CDC7O00311 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDC7O00311 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDC7O00311 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDC7O00311 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDC7O00311 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDC7O00311 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDC7O00311 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDC7O00311 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDC7O00311 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDC7O00311 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDC7O00311 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms