Protein–RNA interactions for Protein: O00253

AGRP, Agouti-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRPO00253 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AGRPO00253 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AGRPO00253 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AGRPO00253 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AGRPO00253 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AGRPO00253 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AGRPO00253 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AGRPO00253 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AGRPO00253 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AGRPO00253 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AGRPO00253 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AGRPO00253 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
AGRPO00253 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AGRPO00253 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AGRPO00253 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
AGRPO00253 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AGRPO00253 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AGRPO00253 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AGRPO00253 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AGRPO00253 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AGRPO00253 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AGRPO00253 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AGRPO00253 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AGRPO00253 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
AGRPO00253 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AGRPO00253 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AGRPO00253 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
AGRPO00253 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AGRPO00253 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AGRPO00253 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AGRPO00253 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AGRPO00253 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AGRPO00253 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AGRPO00253 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AGRPO00253 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AGRPO00253 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AGRPO00253 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AGRPO00253 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AGRPO00253 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AGRPO00253 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AGRPO00253 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AGRPO00253 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AGRPO00253 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AGRPO00253 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AGRPO00253 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AGRPO00253 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AGRPO00253 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AGRPO00253 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AGRPO00253 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AGRPO00253 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AGRPO00253 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AGRPO00253 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AGRPO00253 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AGRPO00253 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AGRPO00253 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AGRPO00253 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AGRPO00253 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AGRPO00253 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AGRPO00253 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AGRPO00253 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AGRPO00253 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AGRPO00253 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AGRPO00253 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AGRPO00253 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AGRPO00253 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AGRPO00253 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AGRPO00253 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AGRPO00253 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AGRPO00253 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AGRPO00253 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AGRPO00253 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AGRPO00253 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AGRPO00253 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AGRPO00253 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AGRPO00253 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AGRPO00253 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AGRPO00253 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
AGRPO00253 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AGRPO00253 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AGRPO00253 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AGRPO00253 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AGRPO00253 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AGRPO00253 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AGRPO00253 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AGRPO00253 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AGRPO00253 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AGRPO00253 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AGRPO00253 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AGRPO00253 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
AGRPO00253 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AGRPO00253 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AGRPO00253 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AGRPO00253 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AGRPO00253 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
AGRPO00253 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AGRPO00253 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AGRPO00253 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AGRPO00253 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AGRPO00253 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AGRPO00253 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms