Protein–RNA interactions for Protein: H3BSU7

TMX2-CTNND1, TMX2-CTNND1 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX2-CTNND1H3BSU7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMX2-CTNND1H3BSU7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMX2-CTNND1H3BSU7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMX2-CTNND1H3BSU7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMX2-CTNND1H3BSU7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMX2-CTNND1H3BSU7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMX2-CTNND1H3BSU7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMX2-CTNND1H3BSU7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMX2-CTNND1H3BSU7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMX2-CTNND1H3BSU7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMX2-CTNND1H3BSU7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMX2-CTNND1H3BSU7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMX2-CTNND1H3BSU7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMX2-CTNND1H3BSU7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMX2-CTNND1H3BSU7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMX2-CTNND1H3BSU7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMX2-CTNND1H3BSU7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TMX2-CTNND1H3BSU7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMX2-CTNND1H3BSU7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMX2-CTNND1H3BSU7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMX2-CTNND1H3BSU7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMX2-CTNND1H3BSU7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMX2-CTNND1H3BSU7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMX2-CTNND1H3BSU7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMX2-CTNND1H3BSU7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMX2-CTNND1H3BSU7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMX2-CTNND1H3BSU7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMX2-CTNND1H3BSU7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMX2-CTNND1H3BSU7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMX2-CTNND1H3BSU7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMX2-CTNND1H3BSU7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMX2-CTNND1H3BSU7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMX2-CTNND1H3BSU7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMX2-CTNND1H3BSU7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TMX2-CTNND1H3BSU7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMX2-CTNND1H3BSU7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMX2-CTNND1H3BSU7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMX2-CTNND1H3BSU7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TMX2-CTNND1H3BSU7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMX2-CTNND1H3BSU7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMX2-CTNND1H3BSU7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMX2-CTNND1H3BSU7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMX2-CTNND1H3BSU7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMX2-CTNND1H3BSU7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMX2-CTNND1H3BSU7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMX2-CTNND1H3BSU7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMX2-CTNND1H3BSU7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TMX2-CTNND1H3BSU7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMX2-CTNND1H3BSU7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMX2-CTNND1H3BSU7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMX2-CTNND1H3BSU7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMX2-CTNND1H3BSU7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMX2-CTNND1H3BSU7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMX2-CTNND1H3BSU7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMX2-CTNND1H3BSU7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMX2-CTNND1H3BSU7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMX2-CTNND1H3BSU7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMX2-CTNND1H3BSU7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMX2-CTNND1H3BSU7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMX2-CTNND1H3BSU7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMX2-CTNND1H3BSU7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMX2-CTNND1H3BSU7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TMX2-CTNND1H3BSU7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMX2-CTNND1H3BSU7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMX2-CTNND1H3BSU7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMX2-CTNND1H3BSU7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMX2-CTNND1H3BSU7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMX2-CTNND1H3BSU7 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMX2-CTNND1H3BSU7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TMX2-CTNND1H3BSU7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMX2-CTNND1H3BSU7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMX2-CTNND1H3BSU7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMX2-CTNND1H3BSU7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMX2-CTNND1H3BSU7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMX2-CTNND1H3BSU7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMX2-CTNND1H3BSU7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMX2-CTNND1H3BSU7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMX2-CTNND1H3BSU7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMX2-CTNND1H3BSU7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
TMX2-CTNND1H3BSU7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMX2-CTNND1H3BSU7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMX2-CTNND1H3BSU7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMX2-CTNND1H3BSU7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMX2-CTNND1H3BSU7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMX2-CTNND1H3BSU7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMX2-CTNND1H3BSU7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMX2-CTNND1H3BSU7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMX2-CTNND1H3BSU7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMX2-CTNND1H3BSU7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMX2-CTNND1H3BSU7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMX2-CTNND1H3BSU7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMX2-CTNND1H3BSU7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMX2-CTNND1H3BSU7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMX2-CTNND1H3BSU7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMX2-CTNND1H3BSU7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms