Protein–RNA interactions for Protein: A8MT33

SYCE1L, Synaptonemal complex central element protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE1LA8MT33 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYCE1LA8MT33 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYCE1LA8MT33 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYCE1LA8MT33 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYCE1LA8MT33 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYCE1LA8MT33 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYCE1LA8MT33 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYCE1LA8MT33 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYCE1LA8MT33 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYCE1LA8MT33 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYCE1LA8MT33 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYCE1LA8MT33 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYCE1LA8MT33 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYCE1LA8MT33 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SYCE1LA8MT33 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYCE1LA8MT33 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYCE1LA8MT33 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYCE1LA8MT33 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYCE1LA8MT33 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYCE1LA8MT33 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYCE1LA8MT33 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYCE1LA8MT33 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYCE1LA8MT33 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYCE1LA8MT33 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYCE1LA8MT33 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYCE1LA8MT33 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYCE1LA8MT33 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYCE1LA8MT33 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SYCE1LA8MT33 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SYCE1LA8MT33 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SYCE1LA8MT33 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SYCE1LA8MT33 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYCE1LA8MT33 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYCE1LA8MT33 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYCE1LA8MT33 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYCE1LA8MT33 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYCE1LA8MT33 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYCE1LA8MT33 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYCE1LA8MT33 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYCE1LA8MT33 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYCE1LA8MT33 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYCE1LA8MT33 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYCE1LA8MT33 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYCE1LA8MT33 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYCE1LA8MT33 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SYCE1LA8MT33 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYCE1LA8MT33 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYCE1LA8MT33 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYCE1LA8MT33 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYCE1LA8MT33 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SYCE1LA8MT33 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYCE1LA8MT33 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYCE1LA8MT33 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYCE1LA8MT33 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYCE1LA8MT33 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYCE1LA8MT33 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYCE1LA8MT33 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYCE1LA8MT33 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYCE1LA8MT33 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYCE1LA8MT33 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYCE1LA8MT33 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYCE1LA8MT33 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SYCE1LA8MT33 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYCE1LA8MT33 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYCE1LA8MT33 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYCE1LA8MT33 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYCE1LA8MT33 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYCE1LA8MT33 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYCE1LA8MT33 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYCE1LA8MT33 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYCE1LA8MT33 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYCE1LA8MT33 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYCE1LA8MT33 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYCE1LA8MT33 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYCE1LA8MT33 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SYCE1LA8MT33 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYCE1LA8MT33 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYCE1LA8MT33 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYCE1LA8MT33 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYCE1LA8MT33 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SYCE1LA8MT33 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYCE1LA8MT33 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYCE1LA8MT33 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SYCE1LA8MT33 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYCE1LA8MT33 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYCE1LA8MT33 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYCE1LA8MT33 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SYCE1LA8MT33 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYCE1LA8MT33 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYCE1LA8MT33 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYCE1LA8MT33 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SYCE1LA8MT33 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYCE1LA8MT33 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SYCE1LA8MT33 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYCE1LA8MT33 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYCE1LA8MT33 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYCE1LA8MT33 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYCE1LA8MT33 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYCE1LA8MT33 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYCE1LA8MT33 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms