Protein–RNA interactions for Protein: A6NNM8

TTLL13P, Tubulin polyglutamylase TTLL13P, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL13PA6NNM8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTLL13PA6NNM8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTLL13PA6NNM8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TTLL13PA6NNM8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTLL13PA6NNM8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTLL13PA6NNM8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTLL13PA6NNM8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TTLL13PA6NNM8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TTLL13PA6NNM8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TTLL13PA6NNM8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TTLL13PA6NNM8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TTLL13PA6NNM8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TTLL13PA6NNM8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TTLL13PA6NNM8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TTLL13PA6NNM8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTLL13PA6NNM8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTLL13PA6NNM8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTLL13PA6NNM8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TTLL13PA6NNM8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTLL13PA6NNM8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTLL13PA6NNM8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTLL13PA6NNM8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TTLL13PA6NNM8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TTLL13PA6NNM8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TTLL13PA6NNM8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TTLL13PA6NNM8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TTLL13PA6NNM8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TTLL13PA6NNM8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TTLL13PA6NNM8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TTLL13PA6NNM8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TTLL13PA6NNM8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TTLL13PA6NNM8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TTLL13PA6NNM8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TTLL13PA6NNM8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TTLL13PA6NNM8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TTLL13PA6NNM8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTLL13PA6NNM8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTLL13PA6NNM8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTLL13PA6NNM8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TTLL13PA6NNM8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TTLL13PA6NNM8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TTLL13PA6NNM8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TTLL13PA6NNM8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TTLL13PA6NNM8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TTLL13PA6NNM8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TTLL13PA6NNM8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TTLL13PA6NNM8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TTLL13PA6NNM8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TTLL13PA6NNM8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TTLL13PA6NNM8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TTLL13PA6NNM8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TTLL13PA6NNM8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TTLL13PA6NNM8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TTLL13PA6NNM8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TTLL13PA6NNM8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TTLL13PA6NNM8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TTLL13PA6NNM8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TTLL13PA6NNM8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TTLL13PA6NNM8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TTLL13PA6NNM8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TTLL13PA6NNM8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TTLL13PA6NNM8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TTLL13PA6NNM8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TTLL13PA6NNM8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TTLL13PA6NNM8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TTLL13PA6NNM8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TTLL13PA6NNM8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TTLL13PA6NNM8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TTLL13PA6NNM8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TTLL13PA6NNM8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TTLL13PA6NNM8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TTLL13PA6NNM8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TTLL13PA6NNM8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TTLL13PA6NNM8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TTLL13PA6NNM8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTLL13PA6NNM8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTLL13PA6NNM8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TTLL13PA6NNM8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTLL13PA6NNM8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTLL13PA6NNM8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTLL13PA6NNM8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TTLL13PA6NNM8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TTLL13PA6NNM8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TTLL13PA6NNM8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TTLL13PA6NNM8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TTLL13PA6NNM8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TTLL13PA6NNM8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TTLL13PA6NNM8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TTLL13PA6NNM8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TTLL13PA6NNM8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TTLL13PA6NNM8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TTLL13PA6NNM8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TTLL13PA6NNM8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TTLL13PA6NNM8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TTLL13PA6NNM8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TTLL13PA6NNM8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TTLL13PA6NNM8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TTLL13PA6NNM8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TTLL13PA6NNM8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TTLL13PA6NNM8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms